Screening kandidátních genů u karcinomu prostaty

Abstract

Karcinóm prostaty je považovaný za jeden z hlavných medicínskych problémov v mužskej populácii, pretože ide o najčastejšie diagnostikovaný zhubný nádor u mužov. Zároveň je to karcinóm s druhou najvyššou mortalitou spomedzi všetkých diagnostikovaných zhubných ochorení v ČR (ÚZIS). Jediným spoľahlivým diagnostickým biomarkerom je v súčasnosti PSA (prostate specific antigen; prostatický špecifický antigén), ktorého hladina je v prípade karcinómu prostaty zvýšená. Táto diplomová práca sa zaoberá štúdiom zmien v expresii génov v karcinóme prostaty, ktoré sú, podľa najnovšej literatúry, spájané s progresiou nádoru a mohli by mať prognostický význam. Ide o gény: VCL (vinculin; vinkulín), SHB (Src homology 2 binding protein) a OCT3 (organic cation transporter 3; transportér 3 katiónov organických zlúčenín). Práca metodicky zahŕňala spracovanie 82 zozbieraných vzoriek prostatického tkaniva a to formou izolácie mRNA. Následne bola použitá metóda RT-PCR k získaniu cDNA, potom elektroforetické spracovanie cDNA a štatistické vyhodnotenie výsledkov. Bola porovnaná relatívna expresia jednotlivých génov vo vzorkách karcinómu prostaty a vo vzorkách BPH (benign prostatic neoplasia; benígna prostatická hyperplázia). Pri génoch SHB a OCT3 bola zistená nižšia expresia vo vzorkách karcinómu prostaty, pri VCL nebol...

Prostate carcinoma is considered to be one of the main medical problem in male population. Prostate carcinoma is the most frequently diagnosed malignancy in men and the death rate has the second position within all diagnosed malignancies in Czech Republic (ÚZIS). There is only one reliable diagnostic tool: PSA (prostate specific antigen). Level of PSA is often elevated in men with prostate carcinoma. This diploma thesis is focused on study of changes in gene expression in prostate carcinoma. Three candidate genes were analyzed: VCL (vinculin), SHB (Src homology 2 binding protein) and OCT3 (organic cation transporter 3). According to recent publications, these genes are related to tumor progression and they could have prognostic significance. In this thesis the following methodological approaches were used: 82 prostatic specimens were collected from patients and mRNA was isolated from these specimens; then RT-PCR was used to obtain cDNA, fragments were detected by electrophoresis. At the end statistical methods were used for evaluation. Relative expression of the genes in prostate carcinoma tissue was compared to relative expression of the genes in BPH (benign prostatic neoplasia) tissue. Results showed higher expression of genes SHB and OCT3 in prostate carcinoma tissue in compariscon to BPH...