Vliv modifikací rRNA na iniciaci translace u eukaryot
Influence of rRNA modifications on translation initiation in eukaryots
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/52798Identifikátory
SIS: 115576
Kolekce
- Kvalifikační práce [19113]
Autor
Vedoucí práce
Konzultant práce
Vopálenský, Václav
Oponent práce
Kouba, Tomáš
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Genetika, molekulární biologie a virologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
10. 6. 2013
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
rRNA, 2'-O-methylace, iniciace translace, vnitřní vazebné místo pro ribosom, IRES, ribosomKlíčová slova (anglicky)
rRNA, 2'-O-methylation, translation initiation, internal ribosome entry site, IRES, ribosomeModifikace ribosomální RNA se vyskytují u všech živých organismů. Funkce modifikací rRNA mohla začít být studována až ve chvíli, kdy byl popsán způsob vzniku těchto modifikací. V současné době se vědci zaměřují nejen na studium jednotlivých modifikací, ale i na význam celkové úrovně modifikací rRNA pro zrání a funkci ribosomu. Tato práce se zabývá vlivem 2'-O-methylací na cytidinu 1639 a adenosinu 100 v 18S rRNA a uridinu 2729 ve 25S rRNA na iniciaci translace u kvasinky Saccharomyces cerevisiae se zvláštním zřetelem na iniciaci translace řízené vnitřním vazebným místem pro ribosom (IRES). V průběhu diplomové práce byly úspěšně vytvořeny kmeny s delecí v genech snR51, snR70 a s dvojitou delecí v obou zmíněných genech. Byly provedeny pilotní experimenty, které ukázaly na význam produktů obou genů v iniciaci translace.
Modifications of ribosomal RNA are present in every livivng organism. The function of rRNA modifications could be studied only when the process of modifications was described. Currently, scientists study not only individual modifications but also the importance of global level of modifications for maturation and function of ribosome. This thesis deals with the influence of 2'-O-methylation of citidine 1639 and adenosine 100 in 18S rRNA and uridine 2729 in 25S rRNA on initiation in yeast Saccharomyces cerevisiae with special attention of translation controlled by internal ribosome entry site (IRES). Strains with deletion in genes snR51, snR70 and duoble deletion in both genes were successfully created during my master study. Pilot experiments showed the importance of products of both genes in translation initiation.