Štúdium translačných iniciačných faktorov eIF3 a eIF4E v leukemických bunkových líniach

Abstract

eIF3 a eIF4E patria medzi dôležité eukaryotické translačné faktory. eIF3 sa účastní v podstate na každom kroku iniciácie translácie, eIF4E je významný hlavne kvôli svojej schopnosti viazať sa k čiapočke. Faktor eIF3 sa u cicavcov skladá z 13 podjednotiek, u mnohých týchto podjednotiek bola zistená funkcia aj mimo transláciu - napríklad apoptóza a mitóza. Bolo dokázané, že zvýšená alebo znížená expresia niektorých podjednotiek eIF3, rovnako ako zvýšená expresia eIF4E, je spojená s rôznymi druhmi nádorov a malignít u ľudí. V prvej časti svojej práce som sa venovala skúmaniu množstva transkriptov podjednotiek eIF3a, b, d, e, f, g, h, i, j v bunkových líniách, ktoré sa používajú na štúdium akútnej lymfoblastickej leukémie. Snažila som sa zistiť, či je rozdiel v množstve transkriptov pre vybrané podjednotky medzi líniami a medzi líniami a kontrolnou líniou. Na základe prevedených pokusov a následnej štatistickej analýzy sa podarilo dokázať zvýšené množstvo mRNA pre eIF3b podjednotku v kontrolnej línii NC-NC oproti použitým leukemickým líniám s výnimkou línie NALM6. Ostatné rozdiely neboli štatistické významné. V druhej časti práce som sa venovala analýze 3' UTR oblastí transkriptov eIF4E1 a využitiu polyadenylačných signálov u tohto transkriptu. Opäť boli použité leukemické bunkové línie. Z pokusov jednoznačne...

eIF3 and eIF4E are very important eukaryotic translation initiation factors. eIF3 is practically involved in every step of translation initiation, eIF4E is important mainly for its ability to bind the cap. Mammalian factor eIF3 consists of thirteen subunits, many subunits have a function apart from translation, such as in apoptosis and mitosis. It was proved that upregulated or downregulated expression of some subunits as well as upregulated expression of eIF4E is linked with different types of tumours and malignancies in human. In the first part of my work, I was examining the amount of transcripts of subunits eIF3a, b, d, e, f, g, h, i and j in cell lines which are used for study of acute lymphoblastic leukaemia. I tried to find if there is a difference in the amount of trancripts between lines or between lines and control line in these subunits. According to experiments and statistical analysis, I proved increased amount of mRNA for eIF3b subunit in control cell line NC-NC in comparison with other used leukaemic cell line except from line NALM6. Other differences were not statistically important. In the second part of my work, I was analysing 3' UTR region of transcripts of eIF4E1 and utilising of polyadenylation signals in this trancript. I used the leukeamic cell lines again. The experiments clearly...