Regulace genové exprese HSP70 genů a její závislost na genotypu HSP70 genů.

Abstract

Předkládaná diplomová práce prezentuje problematiku míry regulace genové exprese tří HSP70 genů v mononukleárních buňkách periferní krve. Sledovali jsme závislosti regulace (inducibility) genové exprese na vybraných bodových mutací - SNP (single nucleotide polymorphisms) v těchto genech. Mononukleární buňky jsme získali z periferní žilní krve zdravých jedinců. Pro analýzu exprese jsme selektovali jedince, kteří byli homozygotní alespoň v jedné ze sledovaných bodových mutací. Při zohledňovaní kritéria zdravého jedince jsme vycházeli z dotazování se na úrovni osobní anamnézy. Závislost míry regulace genové exprese studovaných genů na genotypech - sledovaných polymorfismech jsme stanovovali u dvou buněčným stresem indukovatelných genů HSP70-1 (HSPA1A) a HSP70-2 (HSPA1B) a u jednoho konstitutivně exprimovaného genu HSP70-Hom (HSPA1L). Geny HSP70 jsou lokalizovány v oblasti hlavního histokompatibilního systému MHC (major histocomatibility complex) na chromozómu 6p21. Míru regulace genové exprese studovaných genů jsme stanovovali v závislosti na SNPs lokalizovaných v genu HSP70-1 (-110A/C ~ rs1008438 a +190G/C ~ rs1043618), v genu HSP70-2 (+1267A/G ~ rs1061581 a +2074G/C ~ rs539689) a v genu HSP70-Hom (+2437T/C ~ rs2227956). Míru regulace genové exprese studovaných genů jsme dále stanovovali v závislosti...

The topic of the presented thesis is the regulation of gene expression level of the three HSP70 genes in mononuclear cells. We investigated the dependence of expression regulation (induction) abiliy on selected point mutations, so-called SNPs (single nucleotide polymorphism) in the observed genes. The mononuclear cells were obtained from peripheral blood samples of healthy individuals. In order to analyze their gene expression, we selected individuals who were homozygous for at least one of the monitored point mutations. Taking into account the chosen criteria for healthy individuals we based on interviews with these individuals and their personal history. We determined the polymorphisms observed in two cell stress-inducible HSP70-1 (HSPA1A) and HSP70-2 (HSPA1B) genes and in one constitutively expressed gene HSP70-Hom (HSPA1L). Further, we have analyzed HSP70s gene expression regulation and the relation between the expression regulation and studied polymorphisms. We determined the degree of regulation of a gene expression in the studied genes in relation to two SNPs -110A/C (rs1008438), +190G /C (rs1043618) gene HSP70-1, and two SNPs +1267A/G (rs1061581), +2074G /C (rs539689 ) of the HSP70-2 gene, and the mutation of one five-nucleotide (rs9281590) HSP70-2 gene, and one SNP +2437T/C (rs2227956) of...