Studium abiotického stresu u rostlin na úrovni proteomu

Abstract

Klíčová slova: Arabidopsis thaliana, fytoremediace, abiotický stres, ibuprofen, doxorubicin, dvoudimenzionální elektroforéza Farmaceutický průmysl v dnešní době zažívá značný rozvoj, který je určován stále se zvyšujícím počtem onemocnění, životním stylem a z toho vyplývající zvýšenou poptávkou po léčivech. Přímo úměrně s tímto trendem roste i zájem o analýzy obsahu reziduí léčiv v životním prostředí, která se do něj dostávají jakožto důsledek nedokonalého zpracování odpadních vod. Předložená diplomová práce se zabývá studiem působení cytostatik, konkrétně doxorubicinu a jednoho z nejpoužívanějších analgetik - ibuprofenu, na úrovni proteomu modelové rostliny Arabidopsis thaliana. Proteiny izolované z rostlin vystavených účinku léčiv byly dále separovány dvojdimenzionální elektroforézou. Srovnáním proteinových map programem PDQest (Bio-Rad, USA) bylo nalezeno několik proteinů, jejichž exprese by mohla být ovlivněna přítomností léčiva v kultivačním médiu. Vybrané proteiny byly identifikovány pomocí LC - MS/MS.

Keywords: Arabidopsis thaliana, phytoremediation, abiotic stress, ibuprofene, doxorubicin, two-dimensional electrophoresis Nowadays, develop of the pharmaceutical industry is very fast. Reason of this trend is ever-increasing number of diseases, lifestyle and still increasing demand for the drugs. With this trend growing interest in the analysis of the residues of pharmaceuticals in the environment which is result of incomplete wastewater treatment. This diploma thesis is studying effect of cytostatic drugs, specifically doxorubicin and one of the most widely used analgesics - ibuprofen, at the proteome level of the model plant Arabidopsis thaliana. Proteins isolated from plants exposed to the drugs were separated by two-dimensional electrophoresis. Comparing of protein maps by PDQest program (Bio-Rad, USA) was found several proteins whose expression was affected by the presence of drugs in the culture medium. Selected proteins were identified by LC - MS / MS.