Show simple item record

Analysis of the Yeast Colony Structure: Peroxisomes and Autophagy
dc.creatorŠtěpánek, Luděk
dc.date.accessioned2021-05-19T13:38:35Z
dc.date.available2021-05-19T13:38:35Z
dc.date.issued2012
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/45366
dc.description.abstractAnalysis of yeast colony structure: peroxisomes and autophagy Abstract This study is a part of the project "Molecular biology and physiology of yeast communities". Yeast colonies grown on solid complex medium communicate by periodical release of volatile ammonia (PALKOVÁ et al. 1997), which is accompanied by periodical alkalization of colonies and growth substrate. Transition of colonies to the ammonia producing period of their life is accompanied by global changes of gene expression, as was shown using RNA microarrays (PALKOVÁ et al. 2002). Changes in many metabolic genes were observed, indicating activation of peroxisomal fatty acids β-oxidation, activation of glyoxylate cycle enzymes and inhibition of mitochondrial oxidative phosphorylation. These data suggest a significant switch of cellular metabolism during early alkali phase, based on peroxisomal induction and mitochondrial decline. This switch could be facilitated by autophagy, the process which can selectively or non-selectively remove unnecessary cellular components, providing the cell with energy and removing parts interfering with the new metabolism. Saccharomyces cerevisiae strain expressing peroxisomal GFP was constructed in order to visualise peroxisomes and strain containing GFP-tagged autophagic protein Atg8p was prepared to monitor...en_US
dc.description.abstractAnalýza struktury kvasinkové kolonie Abstrakt Tato práce je součástí projektu "Molekulární biologie a fyziologie kvasinkových společenství". Kvasinkové kolonie rostoucí na pevném médiu komunikují periodickým uvolňováním plynného amoniaku, které je doprovázeno alkalizací kolonií a okolního média. Analýza RNA pomocí mikročipů ukázala, že přechod kolonií do fáze produkce amoniaku je provázen velkými změnami genové exprese. Byly pozorovány změny exprese mnoha metabolických genů, které naznačují aktivaci peroxizomální β-oxidace mastných kyselin, aktivaci glyoxylátového cyklu a inhibici mitochondriální oxidativní fosforylace. Tato data naznačují přepnutí buněčného metabolizmu během rané alkalické fáze. Tuto změnu může usnadnit proces autofágie, během kterého získává buňka energii odstraněním přebytečných buněčných komponent. Pro ověření těchto hypotéz byly připraveny laboratorní kvasinkové kmeny s GFP značenými peroxizómy pro sledování peroxizomální proliferace a kmeny s GFP značeným proteinem Atg8 pro sledování autofágie. Dále byly zavedeny nové metody pro sledování řezů kvasinkových kolonií světelnou a elektronovou mikroskopií. Díky tomu byly popsány dvě hlavní vrstvy buněk v kvasinkové kolonii. Fluorescenční mikroskopie ukázala, že k indukci autofágie a proliferaci peroxizómů dochází pouze v horní vrstvě....cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleAnalýza struktury kvasinkové kolonie: peroxizómy a autofágiecs_CZ
dc.typerigorózní prácecs_CZ
dcterms.created2012
dcterms.dateAccepted2012-07-12
dc.description.departmentDepartment of Genetics and Microbiologyen_US
dc.description.departmentKatedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId124639
dc.title.translatedAnalysis of the Yeast Colony Structure: Peroxisomes and Autophagyen_US
dc.identifier.aleph001493748
thesis.degree.nameRNDr.
thesis.degree.levelrigorózní řízenícs_CZ
thesis.degree.disciplineGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
thesis.degree.disciplineGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
uk.thesis.typerigorózní prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Genetics and Microbiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csUznánocs_CZ
thesis.grade.enRecognizeden_US
uk.abstract.csAnalýza struktury kvasinkové kolonie Abstrakt Tato práce je součástí projektu "Molekulární biologie a fyziologie kvasinkových společenství". Kvasinkové kolonie rostoucí na pevném médiu komunikují periodickým uvolňováním plynného amoniaku, které je doprovázeno alkalizací kolonií a okolního média. Analýza RNA pomocí mikročipů ukázala, že přechod kolonií do fáze produkce amoniaku je provázen velkými změnami genové exprese. Byly pozorovány změny exprese mnoha metabolických genů, které naznačují aktivaci peroxizomální β-oxidace mastných kyselin, aktivaci glyoxylátového cyklu a inhibici mitochondriální oxidativní fosforylace. Tato data naznačují přepnutí buněčného metabolizmu během rané alkalické fáze. Tuto změnu může usnadnit proces autofágie, během kterého získává buňka energii odstraněním přebytečných buněčných komponent. Pro ověření těchto hypotéz byly připraveny laboratorní kvasinkové kmeny s GFP značenými peroxizómy pro sledování peroxizomální proliferace a kmeny s GFP značeným proteinem Atg8 pro sledování autofágie. Dále byly zavedeny nové metody pro sledování řezů kvasinkových kolonií světelnou a elektronovou mikroskopií. Díky tomu byly popsány dvě hlavní vrstvy buněk v kvasinkové kolonii. Fluorescenční mikroskopie ukázala, že k indukci autofágie a proliferaci peroxizómů dochází pouze v horní vrstvě....cs_CZ
uk.abstract.enAnalysis of yeast colony structure: peroxisomes and autophagy Abstract This study is a part of the project "Molecular biology and physiology of yeast communities". Yeast colonies grown on solid complex medium communicate by periodical release of volatile ammonia (PALKOVÁ et al. 1997), which is accompanied by periodical alkalization of colonies and growth substrate. Transition of colonies to the ammonia producing period of their life is accompanied by global changes of gene expression, as was shown using RNA microarrays (PALKOVÁ et al. 2002). Changes in many metabolic genes were observed, indicating activation of peroxisomal fatty acids β-oxidation, activation of glyoxylate cycle enzymes and inhibition of mitochondrial oxidative phosphorylation. These data suggest a significant switch of cellular metabolism during early alkali phase, based on peroxisomal induction and mitochondrial decline. This switch could be facilitated by autophagy, the process which can selectively or non-selectively remove unnecessary cellular components, providing the cell with energy and removing parts interfering with the new metabolism. Saccharomyces cerevisiae strain expressing peroxisomal GFP was constructed in order to visualise peroxisomes and strain containing GFP-tagged autophagic protein Atg8p was prepared to monitor...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
thesis.grade.codeU
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusU


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV