Charakteristika společenstva hub na opadu smrku ztepilého kultivací a analýzou T-RFLP
Characterization of fungal community in spruce (Picea abies) litter using cultivation and T-RFLP
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/42373Identifiers
Study Information System: 76468
Collections
- Kvalifikační práce [20130]
Author
Advisor
Referee
Brabcová, Vendula
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Botany
Department
Department of Botany
Date of defense
14. 9. 2012
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
diverzita hub, sukcese hub, askomycety, bazidiomycety, kultivační metody, molekulární metody, horská smrčina, kůrovecKeywords (English)
fungal diversity, fungal succession, ascomycetes, basidiomycetes, cultivation methods, molecular methods, mountain spruce forest, bark beetleHouby mají důležitou funkci při dekompozici jehličnatého opadu a ovlivňují koloběhy živin v lesních ekosystémech. Proto je kladen velký důraz na prozkoumání diverzity těchto organismů. Cílem této práce bylo popsat diverzitu hub smrkového opadu a vývoj tohoto společenstva v čase na lokalitách regenerujích po kůrovcovém poškození. Dalším cílem bylo porovnat lokality lišící se různou délkou tohoto poškození. Lokality byly vybrány v NP Šumava, kde byly instalovány opadové sáčky s jehličím, které se odebíraly v průběhu třech let. Diverzita hub a změny ve společenstvu byly zjišťovány dvěma metodami: kultivací jehlic na 2ř sladinovém agaru a fingerprintovou metodou T-RFLP. Kultivací jehlic na agarovém médiu bylo v průběhu tříleté sukcese získáno dohromady 71 druhů hub z obou lokalit. Pomocí T-RFLP bylo celkově zaznamenáno 122 různých fragmentů. Dominantními druhy byly Scleroconidioma sphagnicola, Thysanophora penicillioides, Hormonema dematiodes, Ceuthospora pinastri, druhy rodu Chalara, Trichoderma polysporum, Mycena galopus a blíže neurčený druh Helotiales sp. 1. Primární saprotrofové se ve společenstvu vyskytovaly hlavně prvních 8 měsíců, poté je začaly nahrazovat bazidiomycety. Vliv různé délky kůrovcového poškození na druhové složení hub se prokázal jako signifikantní. Tyto rozdíly byly mnohem více patrné pro...
Fungi have a key role in the decomposition of coniferous litter and affect nutrient cycling in forest ecosystems. Therefore, great emphasis is placed on exploring the diversity of these organisms. The aim of this thesis was to describe fungal diversity in spruce litter and revealed temporal development of this community in a forest regenerating after bark beetle outbreak. Another objective was to compare sites with different length of bark beetle damage. The study area was located in the Bohemian Forest mountain range. Litter bags with spruce needles were placed on the forest soil and several samplings were performed in the course of three years. Diversity of fungi and changes in the fungal community were assessed by two methods: cultivation of needles on 2ř MEA and fingerprinting method T-RFLP. In total 71 fungal species were obtained from needles during a three-year succession by cultivation approach. Using T-RFLP 122 different fragments were generally recorded. The dominant species were Scleroconidioma sphagnicola, Thysanophora penicillioides, Hormonema dematiodes, Ceuthospora pinastri, species of genus Chalara, Trichoderma polysporum, Mycena galopus and unknown species Helotiales sp. 1. Primary saprotrophs occured in the community mainly in first 8 months and then were replaced by basidiomycetes....