Molekulárně-dynamické simulace biomolekul
Molecular dynamics simulations of biomolecules
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/42037Identifikátory
SIS: 91698
Katalog UK: 990015003470106986
Kolekce
- Kvalifikační práce [11981]
Fakulta / součást
Matematicko-fyzikální fakulta
Obor
Obecná fyzika
Katedra / ústav / klinika
Fyzikální ústav UK
Datum obhajoby
11. 9. 2012
Nakladatel
Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
Molekulární dynamika, GPCR, Dopamine, EticloprideKlíčová slova (anglicky)
Molecular dynamics, GPCR, Dopamine, EticlopridePráce se zabývá klasickými molekulárně-dynamickými simulacemi časového vývoje biomolekulárního systému. Modelovým systémem je membránový GPCR receptor pro dopamin typu D3 obklopený buněčnou membránou a vodní obálkou s ionty. Cílem bylo postihnout vazebnou schopnost Eticlopridu do aktivního místa GPCR receptoru.
This study deals with classical molecular dynamics simulations of time evolution of a biomolecular system. The simulated system consists of the D3 GPCR membrane receptor for dopamine surrounded by a cell membrane and covered with water molecules and ions. The aim was to analyze the ability of Eticlopride to bind into the active site of the GPCR receptor.