Molekulárně-dynamické simulace biomolekul
Molecular dynamics simulations of biomolecules
bachelor thesis (DEFENDED)
View/
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/42037Identifiers
Study Information System: 91698
CU Catalogue: 990015003470106986
Collections
- Kvalifikační práce [12052]
Faculty / Institute
Faculty of Mathematics and Physics
Discipline
General Physics
Department
Institute of Physics of Charles University
Date of defense
11. 9. 2012
Publisher
Univerzita Karlova, Matematicko-fyzikální fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
Molekulární dynamika, GPCR, Dopamine, EticloprideKeywords (English)
Molecular dynamics, GPCR, Dopamine, EticlopridePráce se zabývá klasickými molekulárně-dynamickými simulacemi časového vývoje biomolekulárního systému. Modelovým systémem je membránový GPCR receptor pro dopamin typu D3 obklopený buněčnou membránou a vodní obálkou s ionty. Cílem bylo postihnout vazebnou schopnost Eticlopridu do aktivního místa GPCR receptoru.
This study deals with classical molecular dynamics simulations of time evolution of a biomolecular system. The simulated system consists of the D3 GPCR membrane receptor for dopamine surrounded by a cell membrane and covered with water molecules and ions. The aim was to analyze the ability of Eticlopride to bind into the active site of the GPCR receptor.