Sledování živých buněk v časových sekvencích

Abstract

Název práce: Sledování živých buněk v časových sekvencích Autor: Tomáš Zámečník Katedra: Kabinet software a výuky informatiky Vedoucí diplomové práce: RNDr. Michal Šorel Ph.D., Oddělení zpracování obrazu ÚTIA AV ČR Abstrakt: Tato diplomová práce se zabývá zkoumáním metod automatického sle- dování částic v sekvencích obrazových snímků. Jejím cílem je návrh a implemen- tace uceleného systému pro sledování živých buněk, jejich pohybu či dělení. Práce využívá závěrů publikovaných vědeckých článků s příbuznou tématikou, zabývá se jejich aplikací a zkoumá možnosti jejich modifikace a zlepšní. Výsledkem jsou dvě aplikace. První z nich je ukázkový program, který je přílohou této práce. Druhá implementace je modulem komerčního softwaru NIS-Elements společnosti Laboratory Imaging, který je využíván vědeckými i soukromými pra- covištěmi po celém světě. Klíčová slova: tracking buněk, tracking částic, buněčné dělení 1

Title: Live-cell tracking in time-lapse sequences Author: Tomáš Zámečník Department: Department of Software and Computer Science Education Supervisor: RNDr. Michal Šorel Ph.D., Oddělení zpracování obrazu ÚTIA AV ČR Abstract: This diploma thesis deals with methods of tracking particles in image sequences. It's goal is to design and implement a complete system for tracking of live cells, their motion and division. The thesis uses conclusions of published scientific papers, studies their application and analyzes possibilities for their mo- difications or improvement. As a result, there are two applications. First of them is a demonstrational pro- gram, provided as an attachment of this thesis. Second implementation is a mo- dule of commercial software NIS-Elements, by Laboratory Imaging, Ltd., which is used by both scientific and commercial institutions in the whole world. Keywords: cell tracking, particle tracking, cell division 1