Příprava a charakterisace rekombinantního dermcidinu jako potenciálního proteinového partnera glutamátkarboxypeptidasy II
Příprava a charakterisace rekombinantního dermcidinu jako potenciálního proteinového partnera glutamátkarboxypeptidasy II
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/38133Identifikátory
SIS: 94370
Kolekce
- Kvalifikační práce [20084]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Pavlíček, Jiří
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Biochemie
Katedra / ústav / klinika
Katedra biochemie
Datum obhajoby
15. 6. 2011
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
angiogenese, glutamátkarboxypeptidasa II, GCPII, dermcidin, proteinová interakceKlíčová slova (anglicky)
angiogenesis, glutamate carboxypeptidase II, GCPII, dermcidin, protein interactionProces novotvorby cévního zásobení je klíčový pro růst a přežití jakéhokoliv pevného nádoru. Zatímco většina nádorů zůstává nevaskularizována a zpravidla nepřesáhne svou velikostí několik milimetrů, některé novotvary prochází tzv. angiogenním přechodem, v důsledku čehož začne docházet tvorbě krevních tělísek. Počet buněk podstupujících apoptosu se snižuje a nádor se začíná rozrůstat. Je známo několik dobře prostudovaných faktorů, jež ovlivňují fyziologické děje spojené s novotvorbou cév. Tyto látky se mohou, ale nemusí vyskytovat i v tkáních nádoru. Glutamátkarboxypeptidáza II (GCPII; EC 3.4.17.21) je transmembránový glykoprotein II. typu, u něhož byly objeveny dvě fyziologicky významné enzymatické aktivity. GCPII je exprimována ve vaskulatuře pevných nádorů, přičemž zde však nebyla pozorována žádná funkce spojená s těmito aktivitami. Přestože se spekuluje o možné receptorové funkci GCPII, přirozený ligand dosud nebyl identifikován. Předcházející experimenty v naší laboratoři naznačily možnost interakce některých proteinů s GCPII. Jeden z nich- dermcidin byl vybrán jako možný vazebný partner, byl naklonován, exprimován v savčích buňkách a poté byla prověřena jeho možná interakce s GCPII pomocí nového detekčního systému využívajícího kotvu FLAG. Interakci in vitro se však nepodařilo potvrdit ani vyvrátit.
A process of forming new blood vessels is necessary for tumour viability and expansion. Without vasculature, tumour stops growing at a size of millimeters. Some tumours, however, undergo an angiogenic switch and start to build up their own vascular architecture. The rate of apoptosis then decreases and the tumour becomes invasive. There are many factors that control the process of physiological angiogenesis. These might or might not relate to tumour tissue as well. Glutamate carboxypeptidase II (GCPII; EC 3.4.17.21) is a type II transmembrane glycoprotein with two known enzymatic activities. GCPII expression is upregulated in prostate cancer and also highly expressed in tumour-associated neovasculature even though none of these enzymatic functions was observed on the endothelium. Although numerous researches suggested that GCPII might serve as a receptor, no natural ligand has been identified yet. Preliminary experiments performed in our laboratory indicated some proteins to be possible natural ligands of GCPII. Therefore, we chose one of them- dermcidin, cloned and expressed this protein in mammalian cells. We investigated its possible interaction with GCPII introducing new detection system utilizing FLAG-tag however, we were not able to approve neither disapprove its interaction in vitro.