Show simple item record

Biochip DNA analysis in the detection of colorectal cancer related mutations
dc.contributor.advisorVaníčková, Zdislava
dc.creatorAdámek, Petr
dc.date.accessioned2017-04-27T07:24:09Z
dc.date.available2017-04-27T07:24:09Z
dc.date.issued2010
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/35064
dc.description.abstractKolorektální karcinom je jedním z nejčastějších nádorových onemocnění vůbec. Pokud se toto závažné onemocnění diagnostikuje včas, je šance na minimálně pětileté přežití velmi vysoká. Běžné metody screeningu a diagnostiky jsou sice poměrně jednoduché i relativně úspěšné, ale přesto nejsou dokonalé - pro samotnou diagnostiku je dosud nutné invazivní vyšetření. Je všeobecná snaha postupy screeningu a diagnostiky pro pacienty ulehčovat a zároveň zpřesňovat. Zde je velká naděje na využití metod molekulární genetiky a biologie včetně biočipových metod. V rámci této diplomové práce byla vyzkoušena možnost optimalizace biočipové metody, původně výrobcem vyvinuté pro zpracování DNA získané ze stolice, pro vzorky genomové DNA z bílých krvinek s cílem zachytit přítomnost případných mutací ve čtyřech cílových genech (K-ras, BRAF, TP53 a APC) s důležitým vztahem k nádoru. Vyhodnocení všech vzorků proběhlo na biočipovém analyzátoru evidence investigatorTM. V diplomové práci jsou shrnuty teoretické poznatky z biologické, klinické i technické stránky věci. Je popsána tato biočipová metoda s ukázkou konkrétního postupu, s uvedením výsledků a s jejich zpracováním i s připojeným komentářem. V souhrnu lze konstatovat, že použitá metoda je relativně náročná na nutný čas práce v laboratoři (pro stanovení ze stolice 3 dny, v...cs_CZ
dc.description.abstractThe colorectal cancer is one of the most common tumour diseases of all. If diagnosed at early stage, there is a reasonable chance for at least five-year survival. Common methods for screening and diagnosis are relatively simple and also quite successive, however (still) not perfect - for proper diagnosis an invasive procedure is necessary. In general there is a significant effort to make the procedures of screening and diagnosis more comfortable for patients as well (to make them) more precise - which means that there is great chance for employing methods of molecular genetics and biology including biochip methods. The purpose of this final-year thesis was to test the possibility of the optimization of this biochip method, originally developed by the manufacturer for ~ 6 ~ testing DNA extracted from faeces, for samples of genomic DNA extracted from white blood cells with the objective to detect possible mutations in four genes of the interest (K-ras, BRAF, TP53 and APC) with a strong relation to this cancer. The evaluation of samples was made on a biochip analyzer Evidence Investigator TM. In the final -year thesis is a summary of theoretical evidence in biological, clinical and also technical side of this affair. The biochip method is described together with an example of the actual procedure, presentation...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova. 1. lékařská fakultacs_CZ
dc.titleVyužití biočipové analýzy DNA k detekci mutací souvisejících s kolorektálním karcinomemcs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2010
dcterms.dateAccepted2010-09-30
dc.description.departmentInstitute of Biophysics and Informatics First Faculty of Medicine Charles University in Pragueen_US
dc.description.departmentÚstav biofyziky a informatiky 1. LF UK v Prazecs_CZ
dc.description.facultyFirst Faculty of Medicineen_US
dc.description.faculty1. lékařská fakultacs_CZ
dc.identifier.repId90538
dc.title.translatedBiochip DNA analysis in the detection of colorectal cancer related mutationsen_US
dc.contributor.refereeKovářová, Jaroslava
dc.identifier.aleph001292593
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineMedical technics and Informaticsen_US
thesis.degree.disciplineZdravotnická technika a informatikacs_CZ
thesis.degree.programSpecializations in Health Serviceen_US
thesis.degree.programSpecializace ve zdravotnictvícs_CZ
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-cs1. lékařská fakulta::Ústav biofyziky a informatiky 1. LF UK v Prazecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFirst Faculty of Medicine::Institute of Biophysics and Informatics First Faculty of Medicine Charles University in Pragueen_US
uk.faculty-name.cs1. lékařská fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFirst Faculty of Medicineen_US
uk.faculty-abbr.cs1.LFcs_CZ
uk.degree-discipline.csZdravotnická technika a informatikacs_CZ
uk.degree-discipline.enMedical technics and Informaticsen_US
uk.degree-program.csSpecializace ve zdravotnictvícs_CZ
uk.degree-program.enSpecializations in Health Serviceen_US
thesis.grade.csVelmi dobřecs_CZ
thesis.grade.enVery gooden_US
uk.abstract.csKolorektální karcinom je jedním z nejčastějších nádorových onemocnění vůbec. Pokud se toto závažné onemocnění diagnostikuje včas, je šance na minimálně pětileté přežití velmi vysoká. Běžné metody screeningu a diagnostiky jsou sice poměrně jednoduché i relativně úspěšné, ale přesto nejsou dokonalé - pro samotnou diagnostiku je dosud nutné invazivní vyšetření. Je všeobecná snaha postupy screeningu a diagnostiky pro pacienty ulehčovat a zároveň zpřesňovat. Zde je velká naděje na využití metod molekulární genetiky a biologie včetně biočipových metod. V rámci této diplomové práce byla vyzkoušena možnost optimalizace biočipové metody, původně výrobcem vyvinuté pro zpracování DNA získané ze stolice, pro vzorky genomové DNA z bílých krvinek s cílem zachytit přítomnost případných mutací ve čtyřech cílových genech (K-ras, BRAF, TP53 a APC) s důležitým vztahem k nádoru. Vyhodnocení všech vzorků proběhlo na biočipovém analyzátoru evidence investigatorTM. V diplomové práci jsou shrnuty teoretické poznatky z biologické, klinické i technické stránky věci. Je popsána tato biočipová metoda s ukázkou konkrétního postupu, s uvedením výsledků a s jejich zpracováním i s připojeným komentářem. V souhrnu lze konstatovat, že použitá metoda je relativně náročná na nutný čas práce v laboratoři (pro stanovení ze stolice 3 dny, v...cs_CZ
uk.abstract.enThe colorectal cancer is one of the most common tumour diseases of all. If diagnosed at early stage, there is a reasonable chance for at least five-year survival. Common methods for screening and diagnosis are relatively simple and also quite successive, however (still) not perfect - for proper diagnosis an invasive procedure is necessary. In general there is a significant effort to make the procedures of screening and diagnosis more comfortable for patients as well (to make them) more precise - which means that there is great chance for employing methods of molecular genetics and biology including biochip methods. The purpose of this final-year thesis was to test the possibility of the optimization of this biochip method, originally developed by the manufacturer for ~ 6 ~ testing DNA extracted from faeces, for samples of genomic DNA extracted from white blood cells with the objective to detect possible mutations in four genes of the interest (K-ras, BRAF, TP53 and APC) with a strong relation to this cancer. The evaluation of samples was made on a biochip analyzer Evidence Investigator TM. In the final -year thesis is a summary of theoretical evidence in biological, clinical and also technical side of this affair. The biochip method is described together with an example of the actual procedure, presentation...en_US
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, 1. lékařská fakulta, Ústav biofyziky a informatiky 1. LF UK v Prazecs_CZ
dc.identifier.lisID990012925930106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV