Characterization of biological and functional features of a new type of CD27- memory B lymphocytes.
Charakterizace biologických a funkčních vlastností nového typu lidských CD27- paměťových B lymfocytů
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/32753Identifiers
Study Information System: 85137
Collections
- Kvalifikační práce [20130]
Author
Advisor
Referee
Šinkora, Marek
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Immunology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
2. 6. 2011
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
B lymfocyty, CD antigeny, běžný variabilní imunodeficit, revmatoidní artritida, VDJ přestavba, průtoková cytometrie, single-cell RT-PCRKeywords (English)
B lymphocytes, CD antigens, common variable immunodeficiency, rheumatoid arthritis, VDJ rearrangement, flow cytometry, single-cellV periferní krvi pacientů s běžným variabilním imunodeficitem (CVID) v porovnání se zdravými dárci byly pozorovány zvýšené frekvence dvou nových B buněčných populací definovaných jako IgM+ CD19+ CD27- CD21low CD38low CD24+ a IgM+ CD19+ CD27- CD21low CD38low CD24- . Cílem studie bylo nalezení takových B buněk u pacientů s revmatoidní artritidou (RA), jejich následná charakterizace a vzájemné porovnání. Produkce imunoglobulinové mRNA u jednotlivých B lymfocytů byla analyzována pomocí průtokové cytometrie s následným tříděním jednotlivých buněk, RT-PCR na úrovni jedné buňky, IgVH-specifické PCR amplifikace, cyklického sekvenování a statistické analýzy. Zaměřili jsme se na analýzu variabilních oblastí těžkého řetězce imunoglobulinů a zjistili jsme významné rozdíly v zastoupení VH, DH a JH genových segmentů, mutační frekvenci, distribuci tichých a záměnných mutací, délce a složení CDR3 oblastí, klonální příbuznosti a expresi RAG genů mezi výše zmíněnými B buněčnými populacemi. Analyzované populace byly považovány za naivní a to zejména z důvodu absence povrchové CD27 molekuly považované za marker B lymfocytů, které prošly antigenně řízenou germinální reakcí. Nicméně rozložení a typ mutací naznačují, že tyto buňky představují nový typ paměťových/antigenně zkušených B lymfocytů (u CVID méně diferencovaných)...
The increased frequencies of two novel B cell populations defined as IgM+ CD19+ CD27- CD21low CD38low CD24+ and IgM+ CD19+ CD27- CD21low CD38low CD24- in peripheral blood of patients with common variable immunodeficiency (CVID) compared to healthy donors were found. The aim was to search for such B cells in patients with rheumatoid arthritis (RA) and their further characterization. The production of immunoglobulin (Ig) mRNA in single B cells was analyzed using flow cytometry, single cell sorting and RT-PCR, IgVH-specific PCR, cycle sequencing and statistical analysis. The study was focused on analysis of variable regions of the heavy chains of Igs and significant differences in the usage of VH, DH and JH gene segments, mutational frequencies, distribution of silent and replacement mutations, length and composition of CDR3 regions, clonal relation and RAG gene expression in above mentioned B cell populations were found. Because of lack of the surface CD27 molecule being regarded as marker of B cells that have undergone antigen-driven germinal reactions, analyzed populations were considered as naive. However, the pattern and type of mutations suggested that these cells could represent a new type of differentiated memory/antigen- experienced B lymphocytes (in CVID less maturated) with the likely role in...