Stanovenie expresných markerov génov HLA II. triedy

Abstract

ÚVOD: Molekuly HLA hrajú centrálnu úlohu v imunitnej odpovedi. HLA II. triedy sa zúčastňujú selekcie T bunkového repertoáru v týmuse a prezentácie antigénnych peptidov CD4-pozitívnym T lymfocytom. HLA II. triedy fungujú ako reštrikčné prvky v prezentácii antigénov T lymfocytom a ich expresia na povrchu buniek je nutná pre spustenie imunitných odpovedí. Regulácia transkripcie génov HLA II. triedy predstavuje komplexný systém zahŕňajúci "cis-acting" DNA sekvenciu a "trans-acting" proteínové faktory. Bol publikovaný alelový polymorfizmus regulačných oblastí génov HLA II. triedy, DQA1, DQB1 a DRB1. Väčšina polymorfizmov je uchovávaná súhlasne s haplotypom. Hierarchia sekvenčnej homológie, ktorá existuje medzi štrukturálnymi génmi, však nemá obdobu medzi ich promótorovými sekvenciami. Zaujalo nás, že najviac prekvapujúci rozpor bol nájdený pre alely viazané k DR4, DQB1*0301 a DQB1*0302, ktoré boli popísané ako časté rizikové faktory pre niektoré autoimunitné choroby. Štrukturálne gény týchto dvoch aliel sú najviac príbuzné, ale ich regulačné sekvencie sú najviac odlišné v porovnaní s ostatnými DQB1 alelami. Tieto sekvenčné rozdiely zodpovedajú funkčnej variabilite: promótorová sila DQB1*0301 alely je trikrát až štyrikrát väčšia než promótorová sila DQB1*0302 alely. Funkčná rozdielnosť medzi alelami HLA...

BACKGROUND: HLA molecules play a central role in the immune response. HLA class II are involved in the selection of the T-cell repertoire in the thymus, and in presentation of antigenic peptides to antigen reactive CD4-positive T cells. The HLA class II act as restriction determinants in the presentation of antigens to T lymphocytes and their expression on the cell surface is necessary for triggering the immune responses. Regulated transcription of HLA class II genes is a complex system involving cis-acting sequence elements and trans-acting protein factors. It has been reported that allelic polymorphism exists in the regulatory regions of HLA class II DQA1, DQB1 and DRB1 genes. Most of the polymorphisms appear to be conserved within a haplotype. The hierarchy of sequence homology which exists among the structural genes is not paralleled among their promoter sequences. It is of interest that the most striking discrepancy was found for the DR4 linked alleles, DQB1*0301 and DQB1*0302, which were described as frequent risk factors for a variety of autoimmune diseases. The structural genes of these two alleles are the most closely related, but their regulatory sequences are the most heterogeneous among DQB1 variants. These sequence differences correspond to functional variation: The promoter strength...