Genetická analýza nádorů hlavy a krku

Abstract

Dlaždicobuněčné karcinomy hlavy a krku (HNSCC = head and neck squamous cell carcinoma) jsou pátou nejčastější skupinou maligních nádorů člověka. Jsou spojeny s vysokou morbiditou způsobenou jak primárním onemocněním, tak následnou léčbou. Léčebné výsledky této skupiny nádorů se výrazně nezlepšují a to navzdory značným pokrokům, kterých bylo v posledních desetiletích dosaženo v chirurgii a onkologii. Ve své práci jsem se zaměřila na analýzu genové exprese séra pacientů s nádory hlavy a krku, která navazovala na předchozí výzkum analýzy genové exprese přímo v nádorové tkáni. Dále jsme též zkoumali analýzu genové exprese v nádorovém stromatu, které se poslední dobou ukazuje jako významný faktor v iniciaci i progresi kancerogeneze. Zjistili jsme několik kandidátních genů, které jsou součástí signalizačních drah související s buněčnou diferenciací a proliferací a které jsou součástí apoptotické dráhy ( BCl-2, BCl-XL a MAX) a zároveň pokles exprese hlavního tumor supresorového genu p53. V peritumorální tkáni jsme zaznamenali zvýšenou expresi cytokinů typických pro embryonální vývoj a diferenciaci ektodermové tkáně - IGF-2 a BMP-4, které v médiu významně ovlivňují fenotyp normálních keratinocytů. Dále jsme identifikovali několik kandidátních genů souvisejících s expresí Gal-1 ve tkáni bohaté na stromální...

Head and neck squamous cell carcinoma is the fifth most common cancer worldwide. They are associated with high morbidity and mortality. Despite considerable advances in surgical and oncological treatment over the past two decades, overall treatment outcome has only slightly improved. In my thesis I focused on serum gene expression analysis of head and neck cancer patients, which followed the tissue gene expression analysis in same patients. Further we investigated gene expression analysis in tumour stroma, which is now considered as significant factor in cancer initiation and progression. We revealed several candidate genes, which are involved in signalling pathways connected with cell differentiation and proliferation and are involved in apoptotic pathway (BCl-2, BCl-XL a MAX). As well we detected down-regulation of the main tumour suppressor p 53 protein. In peritumoural tissue we detected overexpression of cytokines typical for embryonal development and ectoderm differentiation - IGF-2 and BMP-4, which significantly influence the phenotype of normal keratinocytes. Further we identified several candidate genes relating with overexpression of Gal-1 in stromal myofibroblasts rich tissue (SPIN1, FUSIP1, TRIM23, SLC25A40, PTPLAD1, MP3K2). HNSCC is a heterogeneous disease despite the presence of...