Evoluce skupiny Retortamonadida (Eukaryota: Excavata: Fornicata)

Abstract

Řád Retortamonadida je malou skupinou heterotrofních bičíkovců, kteří se dělí do dvou rodů (Chilomastix, Retortamonas). Zástupci obou rodů žijí zejména jako střevní komenzálové obratlovců a bezobralých. V nedávné době byl popsán také jeden volně žijící druh rodu Chilomastix. Poté, co molekulárně-fylogenetické studie prokázaly příbuznost mezi řádem Retortamonadida, Diplomonadida a volně žijícím rodem Carpediemonas, byl vytvořen taxon Fornicata. V současné době tento taxon zahrnuje také volně žijící rody Dysnectes, Hicanonectes, Kipferlia a dva doposud nepopsané rody volně žijících bičíkovců. Řád Retortamonadida byl dlouhou dobu považován za monofyletický taxon. První molekulárně-fylogenetická studie, která zahrnovala sekvenční data obou rodů, ale ukázala, že retortamonády vytváří parafyletický taxon, jehož vnitřní skupinou jsou diplomonády. I přesto retortamonády zůstaly velmi málo prostudovaným taxonem a dodnes mnoho nevíme o příbuzenských vztazích uvnitř řádu Retortamonadida. Hlavním cílem naší práce bylo získat co nejvíce nových sekvenčních dat rodu Retortamonas i Chilomastix. Podařilo se nám získat nové sekvence 14 kmenů řádu Retortamonadida (4 kme-ny rodu Chilomastix, 10 kmenů rodu Retortamonas) a jednoho doposud nepopsaného rodu enteromonád. Rod Retortamonas vytvořil v naší analýze, s vysokou...

Retortamonads (Retortamonadida; genera Chilomastix and Retortamonas) are a small group of protists comprising intestinal commensals of both vertebrates and invertebrates and one free-living species of the genus Chilomastix. Molecular phylogenetic studies showed that retortamonads are closely related to diplomonads, Carpediemonas, Dysnectes, Hicanonectes, Kipferlia and two undescribed lineages of free-living Carpediemonas-like organisms, together forming the monophyletic excavate group Fornicata. For a long time Retortamonadida have been assumed to be a monophyletic group. However, first molecular phylogenetic study including sequence data from both Retortamonas and Chilomastix suggested that Retortamonadida are paraphyletic and that diplomonads branch within Retortamonadida. Retortamonads still remain poorly studied protist group and their phylogeny is unclear. We sequenced and analysed SSU rDNA of ten Retortamonas and four Chilomastix SSU rDNA sequences. In addition, we sequenced SSU rDNA of an undescribed enteromonad lineage. The phylogenetic tree of Fornicata was largely unresolved and the phylogenetic position of the genus Chilomastix remained unclear. On the other hand, the genus Retortamonas and diplomonads formed a robust clade. Retortamonas sequences split into three host-specific lineages. The...