Show simple item record

Comparative genomic prediction of novel transmembrane adaptor proteins and their expression analysis.
dc.contributor.advisorDrbal, Karel
dc.creatorPitule, Pavel
dc.date.accessioned2017-04-20T13:53:46Z
dc.date.available2017-04-20T13:53:46Z
dc.date.issued2010
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/26960
dc.description.abstractTransmembránové adaptorové proteiny (TRAP) jsou důležitou složkou signálních drah vedoucích od imunoreceptorů směrem k efektorovým mechanizmům uvnitř buňky. Přestože nemají vlastní enzymatickou aktivitu, obsahují interakční motivy, kterými organizují další proteiny v čase a prostoru a iniciují efektivní tvorbu signalizačních komplexů. Funkčně nejvýznamnější TRAP jsou ty, které přímo tvoří s receptory nekovalentní komplexy a poskytují svoje intracelulární vazebné motivy, včetně tyrosinového aktivačního motivu (ITAM). Jejich deficit má výrazné dopady na přenos signálu a knockout myši vykazují zřetelný fenotyp. Podobně tomu je i u prvního objeveného TRAP, který není konstitutivně asociovaný s receptory - proteinu LAT. Obsahuje jiné typy motivů, rovněž založené na fosforylovatelném tyrosinu. Podobné strukturální vlastnosti jako protein LAT má v současnosti dalších sedm popsaných proteinů, řazených mezi TRAP. Ani jeden z nich ovšem nevykazuje výrazný fenotyp u deficitních myší. Cílem mojí diplomové práce bylo bioinformaticky prohledat proteinové databáze a identifikovat co nejvíce proteinů, které by svými charakteristikami odpovídali TRAP. Z dosavadních výsledků vyplývá, že skupina TRAP již byla téměř kompletně popsána - v genomu jsme kromě známých TRAP objevili jen málo dalších proteinů, které přesně...cs_CZ
dc.description.abstractTransmembrane adaptor proteins play an important role in signal transduction cascades emanating from immune cell receptors leading to cellular effector mechanisms. Despite the lack of enzymatic function, their sequence contains interaction motifs which organize other proteins in time and space and initiates building of the signaling complexes. Functionally the most important and for the longest time known TRAPs are the ones associated with immune receptors. Their deficiency has severe impacts on the signal transduction and knock-out mice show dramatic phenotypes. The deficiency of Lat - the first discovered TRAP, which is not constitutively associated with immune receptors - has comparable effects on signaling in lymphocytes. The difference between the first group of TRAPs and Lat is not only the type of association with receptors, but also the lack of tyrosine - based activation motifs (ITAMs) in Lat, but Lat contains several other binding motifs also based on the phosphorylation of tyrosine. The group of TRAPs similar to Lat up today contains eight members, but all of them, except of Lat, has only very mild or undetectable phenotype in the knock-out mice. In this work I searched the protein databases for proteins with the characteristics of TRAP using the bioinformatic tools. Based on our...en_US
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleKomparativní genomická předpověď nových transmembránových adaptorových proteinů a jejich expresní analýza.cs_CZ
dc.typediplomová prácecs_CZ
dcterms.created2010
dcterms.dateAccepted2010-06-02
dc.description.departmentDepartment of Cell Biologyen_US
dc.description.departmentKatedra buněčné biologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId66481
dc.title.translatedComparative genomic prediction of novel transmembrane adaptor proteins and their expression analysis.en_US
dc.contributor.refereeNovotný, Marian
dc.identifier.aleph001281898
thesis.degree.nameMgr.
thesis.degree.levelnavazující magisterskécs_CZ
thesis.degree.disciplineImunologiecs_CZ
thesis.degree.disciplineImmunologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
uk.thesis.typediplomová prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra buněčné biologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Cell Biologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csImunologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enImmunologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csVýborněcs_CZ
thesis.grade.enExcellenten_US
uk.abstract.csTransmembránové adaptorové proteiny (TRAP) jsou důležitou složkou signálních drah vedoucích od imunoreceptorů směrem k efektorovým mechanizmům uvnitř buňky. Přestože nemají vlastní enzymatickou aktivitu, obsahují interakční motivy, kterými organizují další proteiny v čase a prostoru a iniciují efektivní tvorbu signalizačních komplexů. Funkčně nejvýznamnější TRAP jsou ty, které přímo tvoří s receptory nekovalentní komplexy a poskytují svoje intracelulární vazebné motivy, včetně tyrosinového aktivačního motivu (ITAM). Jejich deficit má výrazné dopady na přenos signálu a knockout myši vykazují zřetelný fenotyp. Podobně tomu je i u prvního objeveného TRAP, který není konstitutivně asociovaný s receptory - proteinu LAT. Obsahuje jiné typy motivů, rovněž založené na fosforylovatelném tyrosinu. Podobné strukturální vlastnosti jako protein LAT má v současnosti dalších sedm popsaných proteinů, řazených mezi TRAP. Ani jeden z nich ovšem nevykazuje výrazný fenotyp u deficitních myší. Cílem mojí diplomové práce bylo bioinformaticky prohledat proteinové databáze a identifikovat co nejvíce proteinů, které by svými charakteristikami odpovídali TRAP. Z dosavadních výsledků vyplývá, že skupina TRAP již byla téměř kompletně popsána - v genomu jsme kromě známých TRAP objevili jen málo dalších proteinů, které přesně...cs_CZ
uk.abstract.enTransmembrane adaptor proteins play an important role in signal transduction cascades emanating from immune cell receptors leading to cellular effector mechanisms. Despite the lack of enzymatic function, their sequence contains interaction motifs which organize other proteins in time and space and initiates building of the signaling complexes. Functionally the most important and for the longest time known TRAPs are the ones associated with immune receptors. Their deficiency has severe impacts on the signal transduction and knock-out mice show dramatic phenotypes. The deficiency of Lat - the first discovered TRAP, which is not constitutively associated with immune receptors - has comparable effects on signaling in lymphocytes. The difference between the first group of TRAPs and Lat is not only the type of association with receptors, but also the lack of tyrosine - based activation motifs (ITAMs) in Lat, but Lat contains several other binding motifs also based on the phosphorylation of tyrosine. The group of TRAPs similar to Lat up today contains eight members, but all of them, except of Lat, has only very mild or undetectable phenotype in the knock-out mice. In this work I searched the protein databases for proteins with the characteristics of TRAP using the bioinformatic tools. Based on our...en_US
uk.publication.placePrahacs_CZ
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra buněčné biologiecs_CZ
dc.identifier.lisID990012818980106986


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV