Bioinformatika - vývojové stromy

Abstract

Předložená práce se zabývá jedním z hlavních úkolů bioinformatiky: konstrukcí vývojových stromů. Zaměřuje se zejména na metody UPGMA a Neighbour-joining, které slouží pro konstrukci stromů na základě matice vzdáleností mezi genovými či proteinovými sekvencemi. Výsledkem práce je implementace těchto metod v programu s příjemným uživatelským prostředím umožňujícím výsledky metod porovnávat.

Presented work deals with one of the main bioinformatics tasks: construction of phylogenetic trees. It focuses on UPGMA and Neighbour-joining methods which are used to create trees based on the matrix containing distances between gene or protein sequences. The result of the work is the implementation of these methods which is used within the application providing comfortable user interface for comparing the results of the methods.