Show simple item record

Molecular Pathology of Acute Intermittent Porphyria
dc.creatorHrdinka, Matouš
dc.date.accessioned2021-05-19T12:42:21Z
dc.date.available2021-05-19T12:42:21Z
dc.date.issued2009
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.11956/25619
dc.description.abstractMolecular Pathology of Acute Intermittent Porphyria Author: Matouš Hrdinka Acute intermittent porphyria (AIP) is autosomal dominant disorder caused by the partial deficiency of porphobilinogen deaminase (PBGD), the third enzyme in the heme biosynthetic pathway. AIP is manifested by life-threatening acute neurological attacks that can be provoked by various factors such as drugs or alcohol. Objective of this study was to identify and characterize the molecular lesions in Czech and Slovak AIP patients. To identify disease-causing mutations screening was performed by PCR, denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), automated DNA sequencing and restriction fragment lenght polymorphism (RFLP) assays. Total of 35 individuals from 8 families were analyzed to detect asymptomatic carriers. Seven mutations were identified, including 3 novel mutations. Of particular interest, one patient had two mutations R173Q and Q204K, both located in exon 10 on the same allele. To further characterize these mutations, human PBGD was cloned into the pGEX-4T-1 vector and mutations were generated by site-directed mutagenesis. The wild-type and mutated enzyme species were expressed in E. coli as GST fusions and purified by affinity chromatography. Conditions of the PBGD enzyme assay were determined and specific...en_US
dc.description.abstractMolekulární patologie akutní intermitentní porfyrie Autor: Matouš Hrdinka Akutní intermitentní porfyrie (AIP) je autozomálně dominantní dědičné onemocnění způsobené částečným chyběním porfobilinogen deaminázy (PBGD), třetího enzymu v biosyntetické dráze hemu. AIP se projevuje život ohrožujícími akutními neurologickými atakami, které mohou být vyvolány řadou vnějších faktorů, jako jsou léky nebo alkohol. Cílem této studie bylo popsat molekulární podstatu AIP u českých a slovenských pacientů. Mutace v genu pro PBGD byly identifikovány pomocí metody PCR, denaturační gradientové elektroforézy (DGGE), sekvenace a restrikční analýzy (RFLP). Celkem byla vyšetřena DNA 35 pacientů a asymptomatických osob z 8 rodin. Bylo identifikováno 7 různých mutací, z nichž byly 3 nové doposud nepopsané. Zvláštním případem byl pacient se dvěma mutacemi, R173Q a Q204K, lokalizovanými v jedné alele 10. exonu genu pro PBGD. Abychom dále charakterizovali nalezené mutace, gen pro lidskou PBGD byl vložen do pGEX-4T-1 vektoru pro bakteriální expresi a mutace byly připraveny místně specifickou mutagenezí. Nemutovaná a mutované formy PBGD zfůzované s GST proteinem byly poté exprimovány v E. coli a purifikovány afinitní chromatografií. Byly stanoveny podmínky pro měření enzymatické aktivity PBGD a byla určena specifická aktivita,...cs_CZ
dc.languageČeštinacs_CZ
dc.language.isocs_CZ
dc.publisherUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakultacs_CZ
dc.titleMolekulární patologie akutní intermitentní porfyriecs_CZ
dc.typerigorózní prácecs_CZ
dcterms.created2009
dcterms.dateAccepted2009-09-30
dc.description.departmentDepartment of Genetics and Microbiologyen_US
dc.description.departmentKatedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
dc.description.facultyFaculty of Scienceen_US
dc.description.facultyPřírodovědecká fakultacs_CZ
dc.identifier.repId98126
dc.title.translatedMolecular Pathology of Acute Intermittent Porphyriaen_US
dc.identifier.aleph002106642
thesis.degree.nameRNDr.
thesis.degree.levelrigorózní řízenícs_CZ
thesis.degree.disciplineGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
thesis.degree.disciplineGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
thesis.degree.programBiologyen_US
thesis.degree.programBiologiecs_CZ
uk.thesis.typerigorózní prácecs_CZ
uk.taxonomy.organization-csPřírodovědecká fakulta::Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
uk.taxonomy.organization-enFaculty of Science::Department of Genetics and Microbiologyen_US
uk.faculty-name.csPřírodovědecká fakultacs_CZ
uk.faculty-name.enFaculty of Scienceen_US
uk.faculty-abbr.csPřFcs_CZ
uk.degree-discipline.csGenetika, molekulární biologie a virologiecs_CZ
uk.degree-discipline.enGenetics, Molecular Biology and Virologyen_US
uk.degree-program.csBiologiecs_CZ
uk.degree-program.enBiologyen_US
thesis.grade.csUznánocs_CZ
thesis.grade.enRecognizeden_US
uk.abstract.csMolekulární patologie akutní intermitentní porfyrie Autor: Matouš Hrdinka Akutní intermitentní porfyrie (AIP) je autozomálně dominantní dědičné onemocnění způsobené částečným chyběním porfobilinogen deaminázy (PBGD), třetího enzymu v biosyntetické dráze hemu. AIP se projevuje život ohrožujícími akutními neurologickými atakami, které mohou být vyvolány řadou vnějších faktorů, jako jsou léky nebo alkohol. Cílem této studie bylo popsat molekulární podstatu AIP u českých a slovenských pacientů. Mutace v genu pro PBGD byly identifikovány pomocí metody PCR, denaturační gradientové elektroforézy (DGGE), sekvenace a restrikční analýzy (RFLP). Celkem byla vyšetřena DNA 35 pacientů a asymptomatických osob z 8 rodin. Bylo identifikováno 7 různých mutací, z nichž byly 3 nové doposud nepopsané. Zvláštním případem byl pacient se dvěma mutacemi, R173Q a Q204K, lokalizovanými v jedné alele 10. exonu genu pro PBGD. Abychom dále charakterizovali nalezené mutace, gen pro lidskou PBGD byl vložen do pGEX-4T-1 vektoru pro bakteriální expresi a mutace byly připraveny místně specifickou mutagenezí. Nemutovaná a mutované formy PBGD zfůzované s GST proteinem byly poté exprimovány v E. coli a purifikovány afinitní chromatografií. Byly stanoveny podmínky pro měření enzymatické aktivity PBGD a byla určena specifická aktivita,...cs_CZ
uk.abstract.enMolecular Pathology of Acute Intermittent Porphyria Author: Matouš Hrdinka Acute intermittent porphyria (AIP) is autosomal dominant disorder caused by the partial deficiency of porphobilinogen deaminase (PBGD), the third enzyme in the heme biosynthetic pathway. AIP is manifested by life-threatening acute neurological attacks that can be provoked by various factors such as drugs or alcohol. Objective of this study was to identify and characterize the molecular lesions in Czech and Slovak AIP patients. To identify disease-causing mutations screening was performed by PCR, denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), automated DNA sequencing and restriction fragment lenght polymorphism (RFLP) assays. Total of 35 individuals from 8 families were analyzed to detect asymptomatic carriers. Seven mutations were identified, including 3 novel mutations. Of particular interest, one patient had two mutations R173Q and Q204K, both located in exon 10 on the same allele. To further characterize these mutations, human PBGD was cloned into the pGEX-4T-1 vector and mutations were generated by site-directed mutagenesis. The wild-type and mutated enzyme species were expressed in E. coli as GST fusions and purified by affinity chromatography. Conditions of the PBGD enzyme assay were determined and specific...en_US
uk.file-availabilityV
uk.grantorUniverzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra genetiky a mikrobiologiecs_CZ
thesis.grade.codeU
uk.publication-placePrahacs_CZ
uk.thesis.defenceStatusU


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record


© 2017 Univerzita Karlova, Ústřední knihovna, Ovocný trh 560/5, 116 36 Praha 1; email: admin-repozitar [at] cuni.cz

Za dodržení všech ustanovení autorského zákona jsou zodpovědné jednotlivé složky Univerzity Karlovy. / Each constituent part of Charles University is responsible for adherence to all provisions of the copyright law.

Upozornění / Notice: Získané informace nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora. / Any retrieved information shall not be used for any commercial purposes or claimed as results of studying, scientific or any other creative activities of any person other than the author.

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
Theme by 
@mire NV