Modeling Mitochondrial Morphology

Abstract

Mitochondria are a crucial part in aerobic respiration, they synthesize ATP molecules on the inner mitochondrial membrane(IMM), which has highly com- plex geometries depends on the lipid and protein composition present on the IMM. For the simulation of the membrane, OrganL software was employed and this thesis focuses on the subsequent analysis and classification of the resulting morphologies. The modelling approach was able to reproduce many character- istic cristae structures on the IMM.

Mitochondrie zohrávajú kľúčovú úlohu pri aeróbnom dýchaní; synte- tizujú molekuly ATP na vnútornej mitochondriálnej membráne (IMM), ktorá sa vyznačuje veľmi zložitou geometriou závislou od lipidov a proteínov prítomných v tejto membráne. Na simuláciu membrány bol použitý softvér OrganL a táto práca sa primárne zameriava na následnú analýzu a klasifikáciu výsledných mor- fológií týchto štruktúr. Zvolený modelovací prístup umožnil reprodukovať mnohé charak- teristické štruktúry krist na vnútornej mitochondriálnej membráne.