Eisosomal binding of Xrn1 in regulation of mRNA metabolism

Abstract

Eisosom představuje proteinový komplex vázaný na cytosolickou stranu plazmatické membrány, který u kvasinky Saccharomyces cerevisiae stabilizuje významnou mikrodoménu známou jako membránový kompartment Can1 (MCC). Kromě své strukturální role funguje eisosom jako dynamické regulační centrum, které v sobě zadržuje specifické membránové a cytosolické proteiny, čímž moduluje jejich aktivitu a stabilitu. Xrn1, evolučně konzervovaná cytosolická 5′→3′ exoribonukleáza zodpovědná za obměnu většiny mRNA, je sekvestrována v eisosomu během postdiauxické fáze růstu, tj. metabolického stavu následujícího po přechodu z fermentace na respiraci. Tato sekvestrace vede k oslabení její enzymatické aktivity a ochraně před degradací během nedostatku živin. Sekvestrace Xrn1 je reverzibilní: po doplnění glukózy je Xrn1 rychle uvolněna do cytosolu a její aktivita se obnoví. Ačkoli je sekvestrace Xrn1 na eisosomu známá jižvíce neždeset let,molekulární mechanismus interakcemezi Xrn1 a eisosomem zůstává dosud nevyřešen. V této studii kombinujeme diferenciální lokalizaci fluorescenčně značených variant Xrn1 v mutantech s defektní skladbou MCC/eisosomu a proteomickou analýzu s doplňkovými buněčnými a molekulárně biologickými přístupy, abychom určili strukturální determinanty a metabolické dráhy podílející se na rekrutaci Xrn1 k...