CRL4 as a regulator of intestinal inflammatory responses
CRL4 jako regulátor zánětlivých odpovědí ve střevě
bakalářská práce (OBHÁJENO)
Omezená dostupnost dokumentu
Celý dokument nebo jeho části jsou nepřístupné do 14. 07. 2030
Důvod omezené dostupnosti:
Ochrana duševního vlastnictví, zejména ochrana vynálezů či technických řešení
Zobrazit/
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/209562Identifikátory
SIS: 292440
Kolekce
- Kvalifikační práce [22309]
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Science
Katedra / ústav / klinika
Katedra buněčné biologie
Datum obhajoby
5. 6. 2026
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Angličtina
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
CRL4, cullin-RING ligáza, E3 ubiquitin ligáza, ubiquitinace, střevní imunita, zánět střeva, kolitida, DSS model, myší model, substráty CRL4, proteostáza, regulace signalizaceKlíčová slova (anglicky)
CRL4, cullin-RING ligase, E3 ubiquitin ligase, ubiquitination, intestinal immunity, intestinal inflammation, colitis, DSS model, mouse model, CRL4 substrates, proteostasis, signaling regulationUbiquitin-proteazomový systém reguluje stabilitu proteinů prostřednictvím aktivity E3 ubiquitin ligáz, které zajišťují substrátovou specificitu. Tato bakalářská práce se zaměřila na identifikaci a předběžnou charakterizaci potenciálních substrátů E3 ubiquitin ligázy CRL4DCAF12 , se zaměřením na proteiny související s regulací imunitní odpovědi. Potenciální substráty byly vybrány na základě dat z hmotnostní spektrometrie porovnávající kontrolní U2OS buňky a U2OS buňky s knockoutem DCAF12. V datasetu byly detekovány známé substráty CRL4DCAF12 , včetně MCMBP, MOV10 a CCT5, což podpořilo validitu získaných dat. Mezi potenciálními substrátovými proteiny byl pro další zkoumání vybrán STAT1, a to kvůli centrální roli, kterou plní v interferonové signalizaci a zánětlivých odpovědích. Protože STAT1 neobsahuje typický kyselý C-terminální degron, jeho možné rozpoznávání ligázou CRL4DCAF12 může záviset na alternativním mechanismu. Současně, byly pomocí systému CRISPR/Cas9 připraveny DCAF12 knockout buněčné linie K562 jako model pro budoucí experimenty. Součástí práce byla také předběžná analýza Dcaf12 knockout myší po DSS-indukované kolitidě. Společně tyto výsledky identifikují STAT1 a další proteiny jako potenciální substráty CRL4DCAF12 a poskytují základ pro budoucí výzkum role DCAF12 v imunitních...