Molekulární epidemiologie meticilin rezistentní Staphylococcus aureus a koaguláza negativních stafylokoků

Abstract

The genus Staphylococcus, particularly the species Staphylococcus aureus but also coagulase- negative staphylococci (CoNS), represents important bacterial pathogens with a significant impact on human health. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is among the most significant causes of nosocomial and community-acquired infections, with its ability to accumulate antibiotic resistance genes and virulence factors driven both by clonal expansion and horizontal transfer of genetic elements. On the other hand, CoNS, long considered primarily as skin commensals, are gaining increasing attention as important opportunistic pathogens and simultaneously as potential reservoirs of resistance and virulence genes that may be transferred to S. aureus strains, including MRSA. The aim of this thesis was to characterize the clonal structure and presence of mobile genetic elements among clinical MRSA and CoNS isolates. Clonal analysis revealed a dominant prevalence of the ST225-MRSA-II clone among MRSA isolates, represented mainly by spa- types t003 and t586. Among multiresistant CoNS isolates, the most frequently identified sequence types (STs) in S. epidermidis were ST59-IV, ST87-IV, and ST88, while S. haemolyticus exhibited seven different STs, including ST1, ST3, ST25, ST29, ST39, ST42 and ST65....

Rod Staphylococcus, zejména druh Staphylococcus aureus ale i koaguláza negativní stafylokoky (CoNS - Coagulase-Negative Staphylococci), představují důležité bakteriální patogeny s významným dopadem na lidské zdraví. Meticilin-rezistentní Staphylococcus aureus (MRSA) patří mezi nejvýznamnější původce nozokomiálních i komunitních infekcí, přičemž jeho schopnost akumulovat geny rezistence vůči antibiotikům a faktory virulence je podmíněna jak klonální expanzí, tak horizontálním přenosem genetických elementů. Na druhou stranu CoNS, dlouho považované primárně za součást kožní mikroflóry, získávají stále větší pozornost jako významné oportunní patogeny a zároveň jako potenciální rezervoáry genů rezistence a virulence, které mohou být přeneseny na kmeny S. aureus, včetně MRSA. Cílem této diplomové práce bylo charakterizovat klonální strukturu a přítomnost mobilních genetických elementů mezi klinickými izoláty MRSA a CoNS. Klonální analýza odhalila mezi MRSA izoláty dominující převahu klonu ST225-MRSA-II zastoupenou převážně spa-typy t003 a t586. U izolátů CoNS, které vykazovaly multirezistenci, byly mezi izoláty S. epidermidis nejčastěji identifikovány sekvenční typy ST59-IV, ST87-IV a ST88, zatímco u S. haemolyticus bylo nalezeno 7 různých ST mezi které patřily ST1, ST3, ST25, ST29, ST39, ST42 a ST65....