Izolace, strukturní analýza a in silico predikce vybraných parametrů ADMET u alkaloidů izolovaných z Croton linearis Jacq. (Euphorbiaceae).

Abstract

Nguyen, T. P.: Isolation, Structural Analysis and In Silico Prediction of Selected ADMET Parameters of Alkaloids Isolated from Croton linearis Jacq. (Euphorbiaceae); Diploma Thesis, Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové, Department of Pharmacognosy and Pharmaceutical Botany, Hradec Králové 2025, 93 pages. The subject of this diploma thesis was the isolation and identification of alkaloids from the dichloromethane extract of Croton linearis Jacq. (Euphorbiaceae) and the subsequent in silico prediction of selected ADMET parameters. The alkaloids (+)-cularine, (+)-glaucine and (-)-laudanidine were isolated from selected fractions (i.e. CL-CH2Cl2-7, CL-CH2Cl2-8 a CL-CH2Cl2-13) using chromatographic methods. The structure of the individual compounds was confirmed using GC-MS, LC-MS, NMR analyses and measurements of specific optical rotation. In the in silico evaluation, physicochemical properties (number of hydrogen bond acceptors and donors, total polar surface area, consensus logarithm of octanol/water partition coefficient), pharmacokinetic properties (gastrointestinal absorption, permeability across the blood- brain barrier, cytochrome inhibition and interaction with P-glycoprotein) and toxicological characteristics (oral LD₅₀, toxicity class) were predicted using the SwissADME...

Nguyen, T. P.: Izolace, strukturní analýza a in silico predikce vybraných parametrů ADMET u alkaloidů izolovaných z Croton linearis Jacq. (Euphorbiaceae); Diplomová práce, Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra farmakognozie a farmaceutické botaniky, Hradec Králové 2025, počet stran 93. Předmětem této diplomové práce byla izolace a identifikace alkaloidů z dichlormethanového extraktu rostliny Croton linearis Jacq. (Euphorbiaceae) a následná in silico predikce vybraných parametrů ADMET. Z vybraných frakcí (tj. CL- CH2Cl2-7, CL-CH2Cl2-8 a CL-CH2Cl2-13) byly pomocí chromatografických metod izolovány alkaloidy (+)-kularin, (+)-glaucin a (-)-laudanidin. Struktura jednotlivých sloučenin byla potvrzena pomocí GC-MS, LC-MS, NMR analýz a měřenmí specifické optické otáčivosti. V rámci in silico hodnocení byly pomocí softwarů SwissADME a ProTox-3.0 predikovány fyzikálně-chemické vlastnosti (počet akceptor a donor vodíkových vazeb, celková polární povrchová plocha, konsenzuální logaritmus rozdělovacího koeficientu oktanol/voda), farmakokinetické vlastnosti (gastrointestinální absorpce, propustnost přes hematoencefalickou bariéru, inhibice cytochromů a interakce s P-glykoproteinem) a toxikologické charakteristiky (LD₅₀ po perorálním podání, třída toxicity). Všechny sloučeniny...