Molecular mechanisms of axon guidance
Molekulární mechanismy navigace axonu
dissertation thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/203117Identifiers
Study Information System: 234634
Collections
- Kvalifikační práce [21483]
Author
Advisor
Referee
Novák, Petr
Balík, Aleš
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Developmental and Cell Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
10. 9. 2025
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Pass
Keywords (Czech)
semaforin, plexin, navádění axonu, buněčná signalizace, strukturní biologieKeywords (English)
semaphorin, plexin, axon guidance, signal transduction, structural biology;Přesné zapojení nervového systému závisí na navigačních molekulách axonů a na tom, jak axony navigují ke svým synaptickým cílům. V této práci odhalujeme nové regulační mechanismy semaforinů, největší skupiny navigačních molekul, a jejich plexinových receptorů prostřednictvím dvou odlišných přístupů. Nejprve zkoumáme, jak složky extracelulární matrix, proteoglykany, modulují semaforin-plexinovou signalizaci. Za druhé, zkoumáme downstream efektorové regulační mechanismy MICAL1, které kontrolují cytoskeletální odpověď na semaforin-plexinovou signalizaci. Prostřednictvím funkčních testů se sekretovanými semaforiny z drosophily a strukturální analýzy Sema2b jsme zjistili, že proteoglykany interagují s těmito vodícími molekulami prostřednictvím jejich glykosaminoglykanových (GAG) řetězců. To vedlo k našemu navrhovanému modelu semaforinového můstku, kde GAG řetězce proteoglykanů vázají sekretované semaforiny na buněčné povrchy a prezentují je receptorům na okolo rostoucích axonech. Tato interakce s GAG zabraňuje difúzi semaforinu a vytváří gradienty koncentrace semaforinu, což umožňuje, aby tyto molekuly fungovaly jako naváděcí molekuly krátkého dosahu. Použili jsme kryo-elektronovou mikroskopii a biochemické přístupy k objasnění struktury MICAL1 a odhalení autoinhibičního mechanismu, kde N-terminální...
