Podíl individuálních genotypů na vzniku germinálních forem solidních nádorů dospělého věku

Abstract

Karcinom prsu je nejčastější závažné nádorové onemocnění žen v ČR s rostoucí incidencí. Karcinom ovaria je sice vzácnější ale vykazuje výrazně vyšší úmrtnost kvůli jeho obtížné diagnostice v raných stadiích. Tato práce se zaměřuje na identifikaci žen se zvýšeným rizikem těchto onemocnění na základě polygenní dědičnosti nízce penetrantních variant vyjádřené ve formě skóre polygenního rizika (PRS) pomocí panelového NGS. V rámci studie pro karcinom prsu bylo vyšetřeno 1 329 pacientek (věk diagnózy 20-80) a 1 324 zdravých žen (věk 20-80) bez patogenních variant v predispozičních genech. Vyšetření bylo provedeno na dvou PRS setech, PRS77 a PRS313. Oba sety stratifikovaly ženy podle rizika onemocnění. Ženy v horním decilu PRS měly významně vyšší riziko onemocnění oproti střednímu kvintilu (PRS77: OR = 1,55; p < 0,001; PRS313: OR = 1,87; p < 0,001). V horních 2,5 % PRS313 měly ženy riziko trojnásobné (OR = 3,05; p < 0,001). V rámci kontinuálního rizika PRS313 identifikoval pacientky spolehlivěji (HR per SD = 1,64; p < 0,001) než PRS77 (HR per SD = 1,40; p < 0,001). Totéž bylo pozorováno u kontinuálního rizika v čase (PRS77: p = 0,15; PRS313: p = 0,01). V rámci studie pro karcinom ovaria bylo vyšetřeno 122 pacientek s časným nástupem onemocnění (věk diagnózy 15-31), 85 pacientek se srovnatelnou histologií...

Breast cancer is the most common serious cancer in women in the Czech Republic, with increasing incidence. Ovarian cancer, although rarer, has a significantly higher mortality rate due to the difficulty of diagnosis in the early stages. This study focuses on the identification of women at risk of these diseases based on the polygenic inheritance of low-penetrant SNP, expressed as polygenic risk score (PRS) using panel NGS. In the breast cancer study, 1 329 patients (age at diagnosis 20-80) and 1 324 healthy women (age 20-80) without pathogenic variants in the predisposing genes were examined. The examination was performed using two PRS sets, PRS77 and PRS313. Both sets stratified women according to their disease risk. Women in the top decile had significantly higher risk of disease when compared to the middle quintile (PRS77: OR = 1.55; p < 0.001; PRS313: OR = 1.87, p < 0.001). Women in the top 2.5% of PRS313 had threefold risk (OR = 3.05, p < 0.001). Regarding continuous risk, PRS313 identified female patients more reliably (HR per SD = 1.64; p < 0.001) than PRS77 (HR per SD = 1.40; p < 0.001). The same was observed for continuous risk over time (PRS77: p = 0.15; PRS313: p = 0.01). In the ovarian cancer study, 122 patients with early-onset disease (age at diagnosis 15-31), 85 stage- and...