Metódy štúdia necharakterizovaných proteínov

Abstract

Tato bakalářská práce se věnuje problematice proteinů s neznámou funkcí a možnostem jejich bližší charakterizace. V úvodu představuje širší kontext výzkumu lidského proteomu a zdůrazňuje význam studia proteinů, jejichž role v biologických procesech zatím není zcela objasněna. Následně se zaměřuje na přehled experimentálních metod schopných objasnit trojrozměrnou strukturu proteinů a jejich vlastnosti, se zaměřením na metody, které poskytují komplexní a jednoznačný obraz o jejich prostorovém uspořádání. Hlavní část práce je věnována alternativnímu přístupu k charakterizaci těchto proteinů, konkrétně rozvíjejícím se bioinformatickým nástrojům, které umožňují analýzu a predikci vlastností proteinů bez potřeby laboratorních experimentů. Kromě jejich představení a rozdělení do podkategorií si práce klade za cíl zprostředkovat praktický a srozumitelný návod, který umožní efektivní využití dostupných nástrojů i bez nutnosti pokročilé expertízy v oblasti bioinformatiky.

This bachelor's thesis deals with the issue of proteins with unknown functions and the possibilities for their further characterization. The introduction presents a broader context of human proteome research and emphasizes the importance of studying proteins whose roles in biological processes have not yet been fully described. It then focuses on an overview of experimental methods capable of elucidating the three-dimensional structure of proteins and their properties, with an emphasis on methods that provide a complex and unambiguous view of their spatial arrangement. The main part of the thesis is dedicated to an alternative approach to the characterization of these proteins, specifically the emerging bioinformatics tools that allow for the analysis and prediction of protein properties without the need for laboratory experiments. In addition to presenting and categorizing these tools, the thesis aims to provide a practical and comprehensible guide that enables effective use of the available tools even without advanced expertise in the field of bioinformatics.