Infekce vyvolané Clostridioides difficile: epidemiologie, klonalita a průkaz faktorů virulence

Abstract

9 3 Summary Infections caused by Clostridioides difficile are one of the main risks for hospitalized patients treated with broad-spectrum antibiotics. Nosocomial infection is not only a risk for the patient, but also a significant staffing, space, material and financial burden for healthcare facilities. A well-designed laboratory and clinical strategy for managing these infections has the potential to reduce not only the costs to the healthcare facility, but more importantly, to increase patient safety. The aim of this work is to determine the incidence and prevalence of C. difficile infections in the Regional Hospital Liberec, to analyse the epidemiology of these infections, to optimise laboratory diagnostics, to evaluate the effectiveness of various diagnostic procedures, and to introduce specialised molecular biological methods such as toxinotyping and ribotyping. From June 2017 to June 2018, 556 stool samples were sent from the inpatient wards of the Regional Hospital Liberec for testing for the presence of C. difficile. From this pool, 130 samples were used to compare two commercial laboratory methods for antigen and toxin detection and 31 samples were used to compare methods for molecular biological detection of the toxin B gene. From the total set of 556 samples, 96 C. difficile strains were isolated...

8 2 Souhrn Infekce způsobené Clostridioides difficile jsou jedním z hlavních rizik pro hospitalizované a širokospektrými antibiotiky léčené pacienty. Nozokomiální nákaza s sebou nese nejen riziko pro pacienta, ale také významné personální, prostorové, materiální a finanční nároky na zdravotnické zařízení. Správně nastavená laboratorní a klinická strategie řešení těchto infekcí má potenciál snížit nejen náklady zdravotnického zařízení, ale především zvýšit bezpečí pacientů. Cílem této práce je stanovit incidenci a prevalenci infekcí způsobených C. difficile v Krajské nemocnice Liberec, analyzovat epidemiologii těchto infekcí, optimalizovat laboratorní diagnostiku, zhodnotit efektivnost různých diagnostických postupů, a zavést specializované molekulárně-biologické metody, jakými jsou toxinotypizace a ribotypizace. Od června 2017 do června 2018 bylo z lůžkových oddělení Krajské nemocnice Liberec zasláno na vyšetření přítomnosti C. difficile 556 vzorků stolice. Z tohoto souboru bylo 130 vzorků použito na porovnání dvou komerčních laboratorních metod na detekci antigenu a toxinu a 31 vzorků na porovnání metod pro molekulárně-biologickou detekci genu pro toxin B. Z celého souboru 556 vzorků bylo izolováno 96 kmenů C. difficile a byla u nich provedena ribotypizace. Retrospektivně byla provedena analýza 3954 vzorků...