Proteom nervových kmenových buněk a jeho studium v průběhu cílené diferenciace

Abstract

Student: Mgr. Martina Kubíčková (nar. Žižková) Téma dizertační práce: Proteom nervových kmenových buněk a jeho studium v průběhu cílené diferenciace Školitel: RNDr. Rita Suchá, Ph.D. Škola: Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta Studijní program: Vývojová a buněčná biologie Klíčová slova: nervové kmenové buňky, neurodegenerace, diferenciace, buněčná terapie, proteomika, hmotnostní spektrometrie Abstrakt Neurologická onemocnění postihují velké množství lidí po celém světě a jejich počet každoročně stoupá. V této dizertační práci jsem se zaměřila na neurodegeneraci a nervové kmenové buňky, které představují důležitý experimentální model v neurobiologii a také nadějný prostředek pro léčbu poruch nervové soustavy. Aby bylo možné kmenové buňky v regenerativní terapii bezpečně používat, je nutné je přesně charakterizovat a určit nejen jejich diferenciační potenciál, ale také čistotu buněčné populace použité pro transplantaci. K tomu lze použít dobře definované buněčné markery. V této práci detailně popisuji vývoj cílené hmotnostně-spektrometrické metody Selected Reaction Monitoring (SRM) pro charakterizaci nervových kmenových buněk během jejich diferenciace. Tuto metodu založenou na kvantifikaci skupiny známých proteinových markerů lze použít pro rychlé určení diferenciačního stádia nervových kmenových buněk....

Student: Mgr. Martina Kubíčková (nar. Žižková) Thesis title: The study of neural stem cell proteome in the course of targeted differentiation Supervisor: RNDr. Rita Suchá, Ph.D. University: Charles University, Faculty of Science Study programme: Developmental and Cell Biology Key words: neural stem cells, neurodegeneration, differentiation, cell-based therapy, proteomics, mass spectrometry Abstract Neurological diseases affect millions of people worldwide with growing incidence every year. In this work, I focused on neurodegeneration and neural stem cells which represent an important experimental model for neurobiology, and also a promising tool for the treatment of nervous system disorders. To ensure a safe regenerative therapy, the neural stem cells need to be precisely characterized before transplantation, and their differential potential and cell population purity must be verified. Here, I describe in detail the development of a targeted mass spectrometry method based on Selected Reaction Monitoring (SRM) demonstrating that this method is capable of characterizing neural stem cells upon differentiation. Via measuring well-defined cell markers, the method quantifies selected proteins and allows to determination of the differentiation stages of neural stem cells in a fast and reliable manner. Then, we...