Využitie analýzy transkriptómov jednotlivých buniek a priestorovej transkriptomiky pri štúdiu neurodegeneratívnych chorôb

Abstract

Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and spatially resolved transcriptomics (SRT) have introduced new research possibilities for the central nervous system (CNS). These methods enable simultaneous tracking of the expression of thousands of genes in thousands of cells. Additionally, SRT allows the assignment of analyzed transcriptomes to their spatial positions in the tissue. These methods offer a closer look at the processes occurring in cells and can be utilized in the discovery of various pathological processes. This work focuses on applying these methods to the study of neurodegenerative diseases, specifically Alzheimer's, Parkinson's, and Huntington's diseases. Key words: single-cell RNA sequencing, spatially resolved transcriptomics, neurodege- nerative diseases, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Huntigton's disease

Metódy sekvenovania RNA jednotlivých buniek (single-cell RNA sequencing; scRNA-seq) a priestorovo rozlíšenej transkriptomiky (spatially resolved transcriptomics; SRT) priniesli nové možnosti výskumu centrálneho nervového systému (CNS). Vd'aka nim je dnes možné sledovat' expresiu tisícok génov v tisíckach buniek súčasne. Metódy SRT navyše umožňujú priradit' analyzovaným transkriptom ich priestorovú pozíciu v tkanive. Tieto metódy tak ponúkajú podrobnejší pohl'ad na procesy prebiehajúce v bunkách, čo môže byt' využité pri odhal'ovaní rôznych patologických procesov. Táto práca sa zameriava na aplikáciu a prínos týchto metód pri štúdiu komplexných neurodegeneratívnych ochorení, konkrétne Alzheimerovej, Parkinsonovej a Huntingtonovej choroby. Kl'účové slová: sekvenovanie RNA jednotlivých buniek, priestorovo rozlíšená trans- kriptomika, neurodegeneratívne ochorenia, Alzheimerova choroba, Parkinsonova choroba, Huntingtonova choroba