Role SMN komplexu v biogenezi snRNP částic

Abstract

Malé jaderné ribonukleoproteinové částice (snRNP) jsou esenciální složkou spliceosomu, dynamického proteinového komlexu zajišťujícího RNA sestřih. Tyto částice jsou složeny z jedné malé jaderné RNA, podle níž nesou svůj název, kruhu sedmi Sm nebo LSm proteinů a dalších přidatných proteinů. Všechny snRNP podstupují složitou cestou zrání, probíhající v jádře a cytoplasmě buňky. Jedním z důležitých faktorů biogeneze snRNP je SMN komplex, který je složen z proteinů SMN, Gemin2-8 a Unrip. Jeho nejdůležitější funkcí je zprostředkování sestavení Sm core domény v cytoplasmě buňky, za pomoci proteinového komplexu PRMT5. Dále se také SMN komplex zapojuje do modifikace snRNA, importu snRNP do jádra, nebo samotného sestavení sestřihového komplexu. I přes více jak dvě dekády výzkumů nejsou některé funkce SMN komplexu a jeho částic zcela odhaleny a není tedy zcela jasné v jak velké míře tento komplex ovlivňuje nejen biogenezi snRNP, ale i celého spliceosomu. Cílem této práce je, dle dostupných výzkumů, hlubší popis SMN komplexu a pochopení jeho funkcí v biogenezi snRNP částic. Klíčová slova: SMN komplex, snRNP, snRNA, Sm protein, sestřihový komplex

Small nuclear ribonucleoprotein particles (snRNPs) are an essential component of the spliceosome, a dynamic protein complex that mediates RNA splicing. These particles are composed of a single small nuclear RNA, from which they take their name, a ring of seven Sm or LSm proteins and other accessory proteins. All snRNPs undergo a complex maturation pathway, taking place in the nucleus and cytoplasm of the cell. One important factor in snRNP biogenesis is the SMN complex, which is composed of the SMN, Gemin2-8 and Unrip proteins. Its most important function is to mediate the assembly of the Sm core domain in the cytoplasm of the cell, with the help of the PRMT5 complex. Furthermore, the SMN complex is also involved in snRNA modification, import of the snRNP core, or assembly of the spliceosome itself. Despite more than two decades of research, some of the functions of the SMN complex and its particles have not been fully revealed, and thus it is not clear from the cell to what extent this complex influences not only snRNP biogenesis but also the entire spliceosome. The aim of this work, according to the available research, is to describe the SMN complex in more depth and to understand its functions in snRNP particle biogenesis. Key words: SMN complex, snRNP, snRNA, Sm protein, spliceosome