Unraveling the Enigmatic World of Auxin Signalling: Subcellular and Tissue- Specific Aspects in the Root of Arabidopsis thaliana

Abstract

In this dissertation, my main focus was to advance our understanding of how the plant hormone auxin regulates root growth at the sub-cellular and tissue levels in Arabidopsis thaliana. Auxin controls gene transcription through the SCFTIR1/AFB - Aux/IAA coreceptor complex. Among the TIR1/AFBs auxin receptor family members, TIR1 is strictly localized in the nucleus, while AFB1 is particularly abundant in the cytoplasm but also present in the nucleus. I confirmed the dominant role of AFB1 in controlling rapid auxin responses, such as calcium ion influx, apoplastic alkalinization and rapid root growth inhibition; processes associated with root gravitropism. I discovered a novel AFB1-dependent cytoplasmic auxin perception, and I identified the N-terminal domains of AFB1 and TIR1 crucial in determining their subcellular localization. Furthermore, my research contributed to the discovery that the root surface pH gradient on the root's longitudinal axis is not only regulated by AHA H+ -ATPases, but instead, the rapid auxin response module, comprising the AUX1 auxin influx carrier, AFB1, and the CNCG14 calcium channel, controls the apoplastic pH in the root transition zone. Further, I participated in the discovery of a deeply evolutionarily conserved rapid auxin response pathway that involves the RAF-like kinase,...

V této disertační práci jsem se zaměřil na lepší pochopení toho, jak rostlinný hormon auxin reguluje růst kořenů na subcelulární úrovni a na úrovni jednotlivých pletiv u modelové rostliny Arabidopsis thaliana. Auxin řídí transkripci genů prostřednictvím koreceptorového komplexu sestávajícího z SCFTIR1/AFB - Aux/IAA proteinů. Z rodiny auxinových receptorů TIR1/AFB je TIR1 striktně lokalizován v jádře, zatímco AFB1 se vyskytuje zejména v cytoplazmě, ale je přítomen i v jádře. Ve své práci jsem potvrdil dominantní úlohu AFB1 v řízení rychlých auxinových reakcí, jako jsou rychlý vtok vápenatých iontů, alkalinizace apoplastu a rychlá inhibice růstu kořene; procesy spojené s gravitropismem kořene. Objevil jsem novou dráhu percepce auxinu nacházející se v cytoplazmě a závislé na AFB1 receptoru. Identifikoval jsem N-terminální domény AFB1 a TIR1 klíčové pro určení jejich subcelulární lokalizace. Dále můj výzkum přispěl k objevu, že gradient pH na povrchu kořene na podélné ose kořene není regulován pouze membránovými protonovými ATPázami AHA, ale že apoplastické pH přechodové zóny kořene řídí modul rychlé auxinové odpovědi, který se skládá z přenašeče auxinu AUX1, AFB1 koreceptoru a vápníkového kanálu CNCG14. Dále jsem se podílel na objevu hluboce evolučně konzervované dráhy rychlé auxinové odpovědi, která zahrnuje...