Rezistence k metronidazolu u klinických případů giardiózy.
Metronidazole resistence in clinical cases of giardiasis.
diploma thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/185838Identifiers
Study Information System: 218443
Collections
- Kvalifikační práce [20304]
Author
Advisor
Consultant
Stejskal, František
Referee
Uzlíková, Magdalena
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Parasitology
Department
Department of Parasitology
Date of defense
18. 9. 2023
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
Giardia intestinalis, giardiosa, metronidazol, rezistence, genotypizaceKeywords (English)
Giardia intestinalis, giardiasis, metronidazole, resistence, genotypingMetronidazole (MTZ) cílí na řadu anaerobních bakteriálních a eukaryotických patogenů, včetně prvoka Giardia intestinalis (Metamonada). Přestože je MTZ hojně a dlouho využíván k léčbě giardiózy, příčiny selhání léčby giardiózy (G-TF) nejsou známé. Většina dosavadních poznatků byla získána pomocí linií s laboratorně navozenou rezistencí nebo z klinických vzorů, ke kterým nejsou dostupná klinická data. Ve spolupráci s Fakultní nemocnicí Bulovka v Praze byla v letech 2020-2023 sledována kohorta 70 pacientů, ve které 25,7 % pacientů vykázalo selhání léčby. Pomocí genotypizace bylo zjištěno, že giardie pacientů s G-TF patřily do stejné genetické skupiny (asambláž B, především BIII) a jednalo se pouze o importované nákazy převážně z Indie. Pro ověření hypotézy, zda může být rezistence spojena s určitým mezi liniemi přenosným genotypem, byly sledovány sdílené polymorfismy v genech zapojených v metabolismu MTZ a detoxifikacích (NR1, NR2, prx1, hmp). U G-TF izolátů v NR2 byly nalezeny aminokyselinové záměny (K42E, K139R), které mohou vést ke změnám ve struktuře proteinu. Zároveň byla testována variabilita počtu kopií genů jako spoluvarianta/příčina lékové rezistence v důsledku duplikací nebo delecí genu hmp. Výsledky z dPCR ukázaly rozdíl v počtu kopií hmp mezi sub- asamblážemi BIII a BIV a menší změnu počtu kopií...
Metronidazole (MTZ) targets a spectrum of anaerobic pathogens ranging from bacteria to eukaryotic parasites, including the protist Giardia intestinalis (Metamonada). Despite the long time and widespread use of MTZ, understanding giardiasis treatment failure (G-TF) is incomplete. Most of the knowledge was gained on laboratory-generated resistant lines or on clinical lines without data on the treatment outcome. In cooperation with Bulovka University Hospital in Prague, 70 giardiasis cases were followed between 2020-2023, of which 25.7% exhibited the G-TF. Giardia genotyping revealed that G-TF cases belonged to the same genetic group (assemblage B, mainly BIII); and G-TF cases were all imported, out of which 60% were from returning travellers from India. To test the hypothesis that resistance is genetically determined/associated with a transmissible genotype, genetic polymorphisms shared in Giardia G-TF samples in a set of genes involved in MTZ metabolism and detoxifications (NR1, NR2, prx1, hmp) were examined. The analysis revealed amino acid substitutions (K42E, K139R) in NR2 isolates of G-TF patients, which might affect protein structure. Also, a gene dosage effect as drug resistance co-variant/cause due to gene duplications or deletions of the hmp gene was tested. Results from dPCR revealed that...