Regulace funkce proteinu STING během infekce myším polyomavirem
Regulation of STING function during murine polyomavirus infection
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/185573Identifikátory
SIS: 242521
Kolekce
- Kvalifikační práce [21484]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Pimková Polidarová, Markéta
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Genetika, molekulární biologie a virologie se specializací Virologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra genetiky a mikrobiologie
Datum obhajoby
14. 9. 2023
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
STING, myší polyomavirus, polyomaviry, interferonová odpověď, interferon beta, střední T antigen, ubiquitinace, translokaceKlíčová slova (anglicky)
STING, murine polyomavirus, polyomaviruses, interferon response, interferon beta, middle T antigen, ubiquitination, translocationStimulator of interferon genes (STING) je adaptorovým proteinem signalisační dráhy vrozené imunity, účastnící se detekce dvouvláknové DNA (dsDNA) v cytoplasmě buňky, která ústí v expresi prozánětlivých genů včetně produkce interferonu I. typu. Během infekce dsDNA virem, myším polyomavirem (MPyV), sice dochází k aktivaci proteinu STING, ale výsledná produkce interferonu je pouze mírná. Lze tedy předpokládat, že v buňkách infikovaných MPyV je funkce proteinu STING regulována. Cílem této diplomové práce bylo prozkoumat tři mechanismy, kterými může k regulaci docházet, a to prostřednictvím proteinových interakčních partnerů, posttranslačních modifikací, nebo změny vnitrobuněčné lokalisace proteinu STING. Pro usnadnění výzkumu byla ustanovena linie myších fibroblastů stabilně exprimující proteinu STING fúzovanou s HA-kotvou. Dále byly připraveny dva plasmidy kódující protein STING fúzovaný se zeleným fluorescenčním proteinem, usnadňující sledování lokalisace proteinu v buňce, či s kompositní kotvou obsahující in vivo biotinylovanou značku BioEaseTM tag umožňující efektivní isolaci proteinu STING. Výsledky pozorování kolokalisace v buňce a koimunoprecipitace naznačují, že by protein STING mohl interagovat s virovým středním T antigenem. Byla nalezena i neočekávaná interakce s virovým velkým T antigenem....
Stimulator of Interferon Genes (STING) is the adapter protein of an innate immunity signalling pathway, involved in detection of double-stranded DNA (dsDNA) in the cell cytoplasm, which leads to the expression of pro-inflammatory genes, including the production of type I interferon. Eventhough during the infection with a dsDNA virus, murine polyomavirus (MPyV), the STING protein is activated, the resulting interferon production is moderate. Therefore, it can be assumed that the function of the STING protein is regulated in MPyV-infected cells. The aim of this thesis was to investigate three mechanisms by which the regulation can occur, namely through protein interaction partners, post- translational modifications, or changes in the subcellular localization of the STING protein. A cell-line of mouse fibroblasts stably expressing the STING protein fused with the HA-tag was established to facilitate the research. Furthermore, two plasmids were prepared, that encode the STING protein fused with the green fluorescent protein, facilitating the monitoring of the localization of the protein in the cell, or with a composite tag containing an in vivo biotinylated BioEaseTM -tag enabling effective isolation of the STING protein. The results of colocalization observations and coimmunoprecipitation suggest that...
