Bioorthogonal labelling of surface receptors on living lymphocytes
Bioortogonální značení povrchových receptorů na nefixovaných lymfocytech
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/185542Identifiers
Study Information System: 242225
Collections
- Kvalifikační práce [19609]
Author
Advisor
Referee
Benda, Aleš
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Cell Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
14. 9. 2023
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
T buňka, CD2, CD4, bioortogonální značení, fluorescenční mikroskopieKeywords (English)
T cell, CD2, CD4, bioorthogonal labelling, fluorescence microscopyBuněčný povrch vykazuje vysokou heterogenitu na chemické I geometrické úrovni. Abychom porozuměli funkci buněk, musíme věnovat pozornost morfologickým znakům vytvořeným na plazmatické membráně. Pro studium buněčného povrchu s molekulární specifitou existuje spousta zobrazovacích metod, počínaje konvenční wide-field mikroskopií, přes konfokální mikroskopii, konče super-rezoluční fluorescenční mikroskopií a elektronovou mikroskopií. Studie využívající super-rezoluční mikroskopii prováděné na fixovaných buňkách poskytují podrobná steady-state data o nanoskopické organizaci buněčného povrchu a distribuci molekul v rámci morfologických struktur. Protože jsou však buňky součástí živých organismů a neustále mění své vlastnosti v čase a prostoru, informace o dynamice buněčných struktur a pohyblivosti molekul zůstávají při použití tohoto přístupu skryty. Ke studiu dynamických změn na úrovni jedné molekuly jsou nutné metody kompatibilní s životaschopností buněk. V této studii se zaměřujeme na distribuci a dynamiku molekul CD2 a CD4 exprimovaných na povrchu nestimulovaných T buněk. Hlavním cílem této práce bylo vyvinout novou metodu pro zobrazování živých buněk a sledování jednotlivých molekul membránově-vázaných protein ve 3D a s nanometrovou přesností. Pomocí takového nástroje lze zkoumat dynamiku...
The surface of cells displays high heterogeneity on chemical and geometrical levels. To understand the function of cells, we need to pay attention to the morphological features formed at the plasma membrane. To study cell surface with molecular specificity, there are plenty of imaging methods starting with the conventional wide-field microscopy through confocal microscopy, ending with super-resolution fluorescence microscopies and electron microscopies. Super-resolution microscopy studies conducted on the fixed cells provide detailed steady-state data about the cell surface nanoscopic organisation and distribution of molecules at the morphological structures. However, since cells are parts of living organisms and constantly change their properties in time and space, the information about dynamics of cellular structures and motility of molecules remains hidden when using this approach. Live-cell compatible methods are required to study dynamic changes of molecules at the single-molecule level. In this study we are focusing on the distribution and dynamics of molecules CD2 and CD4 expressed on the surface of non-stimulated T cells. The main aim of this thesis was to develop a novel method for live-cell imaging and single-molecule tracking of membrane-bound proteins in 3D and at nanoscale. With such a...