Interakce ARP2/3 s komponentami rostlinné sekretorické dráhy
ARP2/3 complex interaction with plant secretory pathway components
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/185366Identifikátory
SIS: 241167
Kolekce
- Kvalifikační práce [21632]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Oulehlová, Denisa
Fakulta / součást
Přírodovědecká fakulta
Obor
Experimentální biologie rostlin se specializací Buněčná a molekulární biologie rostlin
Katedra / ústav / klinika
Katedra experimentální biologie rostlin
Datum obhajoby
13. 9. 2023
Nakladatel
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaJazyk
Čeština
Známka
Výborně
Klíčová slova (česky)
ARP2, 3, COPI, COG, GNL1, sekretorická dráhaKlíčová slova (anglicky)
ARP2, 3, COPI, COG, GNL1, secretory pathwayARP2/3 je evolučně konzervovaný proteinový komplex, podílející se na nukleaci aktinu. U živočichů mutace podjednotek ARP2/3 je většinou letální. Oproti tomu arp2/3 rostliny jsou životaschopné, ale mají několik morfologických defektů. Jedním z charakteristických fenotypických projevů arp2/3 rostlin je narušená buněčná adheze. To naznačuje roli ARP2/3 komplexu v sekreci rostlinné buněčné stěny, hlavně její pektinové složky. Není však jasně, jaký je přesný molekulární mechanismus funkce ARP2/3 v této dráze. Předběžné výsledky naznačují možnou interakci ARP2/3 s proteiny sekretorické dráhy GNL1, COPI a COG. Tato práce kombinuje dvě metody - TIRFM/VAEM a koimunoprecipitaci - pro hodnocení míry kolokalizace a stanovení interakce ARP2/3 s vybranými markery. Interakce studovaných proteinů s ARP2/3 komplexem však v této práci prokázaná nebyla. Tato práce zároveň popisuje chování COPI, COG a GNL1 pomocí TIRFM/VAEM a naznačila možnou interakci GNL1 s endocytotickým markerem na plazmatické membráně. Klíčová slova: ARP2/3, COPI, COG, GNL1, sekretorická dráha
The ARP2/3 complex is an evolutionarily conserved protein complex involved in actin nucleation. In animals, the loss of function of ARP2/3 subunits is usually lethal. In contrast, arp2/3 plants are viable and exhibit certain morphological defects. One of the characteristic traits of arp2/3 plants is impaired cell adhesion. This suggests a role for the ARP2/3 complex in plant cell wall secretion, specifically pectins. However, the exact molecular mechanism of ARP2/3 function in this pathway has not been elucidated yet. Preliminary results suggest a possible interaction of ARP2/3 with the secretory pathway proteins GNL1, COPI, and COG. This work combines two methods - TIRFM/VAEM and co-immunoprecipitation - to study the interaction of ARP2/3 with selected markers. However, neither colocalization nor physical interaction was demonstrated. This work also characterises COPI, COG and GNL1 with TIRFM/VAEM and shows that there is an interaction between GNL1 and endocytic markers. Key words: ARP2/3, COPI, COG, GNL1, secretory pathway
