dc.contributor.advisor | Obšil, Tomáš | |
dc.creator | Janáčková, Zuzana | |
dc.date.accessioned | 2023-11-06T23:48:26Z | |
dc.date.available | 2023-11-06T23:48:26Z | |
dc.date.issued | 2023 | |
dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.11956/185135 | |
dc.description.abstract | CDK16 is a cell-cycle-related cyclin-dependent kinase that functions primarily in neurite growth processes, axonal transport regulation and sperm development. It also plays a role in the progression of X-linked intellectual disability and, together with its activating partner cyclin Y, in the development and progression of various types of cancer. Consequently, CDK16 and cyclin Y could represent potential new therapeutic targets. Both CDK16 and cyclin Y are structurally atypical among similar proteins, and the mechanism of activation of CDK16 by cyclin Y is unclear. However, it is clear from recent studies that the interaction between CDK16 and cyclin Y requires the prior interaction of cyclin Y with 14-3-3 proteins. In addition, for cyclin Y to interact with 14-3-3 proteins, its phosphorylation on the S100 and S326 binding sites of 14-3- 3 is required. To investigate the mechanism of activation of CDK16 by cyclin Y, we decided to characterize the interaction between CDK16, cyclin Y and 14-3-3 proteins in detail. The interaction between CDK16, cyclin Y and 14-3-3 proteins was characterized using biophysical methods including fluorescence anisotropy measurements, native electrophoresis, size exclusion chromatography and protein crystallography. The for- mation of binary pCCNY-14-3-3 and ternary... | en_US |
dc.description.abstract | CDK16 je cyklin-dependentní kinasa podílející se na regulaci buněčného cyklu. Podílí se především na procesech růstu neuritů, regulaci axonálního transportu a vývoji spermií. Hraje také roli v progresi XLID (z angl. X-linked intellectual dis- ability) a spolu se svým aktivačním partnerem cyklinem Y ve vývoji a progresi různých typů rakoviny. CDK16 a cyklin Y by proto mohly představovat potenciální nové terapeutické cíle. CDK16 i cyklin Y jsou strukturně atypické mezi podobnými proteiny a mecha- nismus aktivace CDK16 cyklinem Y zatím není známý. Z předchozích studií však vyplývá, že interakce mezi CDK16 a cyklinem Y vyžaduje předchozí interakci cyk- linu Y s 14-3-3 proteiny. Pro interakci cyklinu Y s 14-3-3 proteiny je nutná fosforylace jeho 14-3-3 vazebných míst, S100 a S326. S cílem zjistit přesný mechanismus aktivace CDK16 jsme se rozhodli blíže charakterizovat interakci mezi CDK16, cyklinem Y a 14-3-3 proteiny. Pro charakterizaci interakcí mezi CDK16, cyklinem Y a 14-3-3 proteiny byla využita řada biofyzikálních metod, včetně fluorescenční anisotropie, nativní gelové elektroforézy, gelové permeační chromatografie a proteinové krystalografie. Pomocí nativní elektroforézy a gelové permeační chromatografie byla potvrzena tvorba binár- ních pCCNY-14-3-3 a ternárních CDK16-pCCNY-14-3-3 proteinových... | cs_CZ |
dc.language | Čeština | cs_CZ |
dc.language.iso | cs_CZ | |
dc.publisher | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.subject | CDK16 | cs_CZ |
dc.subject | cyklin Y | cs_CZ |
dc.subject | 14-3-3 proteiny | cs_CZ |
dc.subject | krystalografie | cs_CZ |
dc.subject | CDK16 | en_US |
dc.subject | cyclin Y | en_US |
dc.subject | 14-3-3 proteins | en_US |
dc.subject | crystallography | en_US |
dc.title | Mechanismus regulace cyklin-dependentní kinasy 16 prostřednictvím komplexu cyklin Y/14-3-3 | cs_CZ |
dc.type | diplomová práce | cs_CZ |
dcterms.created | 2023 | |
dcterms.dateAccepted | 2023-09-12 | |
dc.description.department | Katedra biochemie | cs_CZ |
dc.description.department | Department of Biochemistry | en_US |
dc.description.faculty | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
dc.description.faculty | Faculty of Science | en_US |
dc.identifier.repId | 242322 | |
dc.title.translated | Regulatory mechanism of the cyclin-dependent kinase 16 through the cyclin Y/14-3-3 complex | en_US |
dc.contributor.referee | Pavlíček, Jiří | |
thesis.degree.name | Mgr. | |
thesis.degree.level | navazující magisterské | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Biochemie | cs_CZ |
thesis.degree.discipline | Biochemistry | en_US |
thesis.degree.program | Biochemie | cs_CZ |
thesis.degree.program | Biochemistry | en_US |
uk.thesis.type | diplomová práce | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-cs | Přírodovědecká fakulta::Katedra biochemie | cs_CZ |
uk.taxonomy.organization-en | Faculty of Science::Department of Biochemistry | en_US |
uk.faculty-name.cs | Přírodovědecká fakulta | cs_CZ |
uk.faculty-name.en | Faculty of Science | en_US |
uk.faculty-abbr.cs | PřF | cs_CZ |
uk.degree-discipline.cs | Biochemie | cs_CZ |
uk.degree-discipline.en | Biochemistry | en_US |
uk.degree-program.cs | Biochemie | cs_CZ |
uk.degree-program.en | Biochemistry | en_US |
thesis.grade.cs | Výborně | cs_CZ |
thesis.grade.en | Excellent | en_US |
uk.abstract.cs | CDK16 je cyklin-dependentní kinasa podílející se na regulaci buněčného cyklu. Podílí se především na procesech růstu neuritů, regulaci axonálního transportu a vývoji spermií. Hraje také roli v progresi XLID (z angl. X-linked intellectual dis- ability) a spolu se svým aktivačním partnerem cyklinem Y ve vývoji a progresi různých typů rakoviny. CDK16 a cyklin Y by proto mohly představovat potenciální nové terapeutické cíle. CDK16 i cyklin Y jsou strukturně atypické mezi podobnými proteiny a mecha- nismus aktivace CDK16 cyklinem Y zatím není známý. Z předchozích studií však vyplývá, že interakce mezi CDK16 a cyklinem Y vyžaduje předchozí interakci cyk- linu Y s 14-3-3 proteiny. Pro interakci cyklinu Y s 14-3-3 proteiny je nutná fosforylace jeho 14-3-3 vazebných míst, S100 a S326. S cílem zjistit přesný mechanismus aktivace CDK16 jsme se rozhodli blíže charakterizovat interakci mezi CDK16, cyklinem Y a 14-3-3 proteiny. Pro charakterizaci interakcí mezi CDK16, cyklinem Y a 14-3-3 proteiny byla využita řada biofyzikálních metod, včetně fluorescenční anisotropie, nativní gelové elektroforézy, gelové permeační chromatografie a proteinové krystalografie. Pomocí nativní elektroforézy a gelové permeační chromatografie byla potvrzena tvorba binár- ních pCCNY-14-3-3 a ternárních CDK16-pCCNY-14-3-3 proteinových... | cs_CZ |
uk.abstract.en | CDK16 is a cell-cycle-related cyclin-dependent kinase that functions primarily in neurite growth processes, axonal transport regulation and sperm development. It also plays a role in the progression of X-linked intellectual disability and, together with its activating partner cyclin Y, in the development and progression of various types of cancer. Consequently, CDK16 and cyclin Y could represent potential new therapeutic targets. Both CDK16 and cyclin Y are structurally atypical among similar proteins, and the mechanism of activation of CDK16 by cyclin Y is unclear. However, it is clear from recent studies that the interaction between CDK16 and cyclin Y requires the prior interaction of cyclin Y with 14-3-3 proteins. In addition, for cyclin Y to interact with 14-3-3 proteins, its phosphorylation on the S100 and S326 binding sites of 14-3- 3 is required. To investigate the mechanism of activation of CDK16 by cyclin Y, we decided to characterize the interaction between CDK16, cyclin Y and 14-3-3 proteins in detail. The interaction between CDK16, cyclin Y and 14-3-3 proteins was characterized using biophysical methods including fluorescence anisotropy measurements, native electrophoresis, size exclusion chromatography and protein crystallography. The for- mation of binary pCCNY-14-3-3 and ternary... | en_US |
uk.file-availability | V | |
uk.grantor | Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta, Katedra biochemie | cs_CZ |
thesis.grade.code | 1 | |
dc.contributor.consultant | Obšilová, Veronika | |
uk.publication-place | Praha | cs_CZ |
uk.thesis.defenceStatus | O | |