Methyltransferázy lidských +ssRNA virů
Methyltransferases of human +ssRNA viruses
bachelor thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/184685Identifiers
Study Information System: 256117
Collections
- Kvalifikační práce [20130]
Author
Advisor
Referee
Otava, Tomáš
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Molecular Biology and Biochemistry of Organisms
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
8. 9. 2023
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Very good
Keywords (Czech)
Flaviviridae, Coronaviridae, +ssRNA viry, NS5, nsp14, nsp16, methyltransferázy, N7 methylace, 2' O methylace, čepičkaKeywords (English)
Flaviviridae, Coronaviridae, +ssRNA viruses, NS5, nsp14, nsp16, methyltransferases, N7 methylation, 2' O methylation, capCílem této bakalářské práce je podat strukturní popis virových methyltransferáz u významných lidských +ssRNA virů, především z čeledi Coronaviridae a Flaviviridae. Nemocemi jako je horečka Dengue, žlutá zimnice, nebo japonská encefalitida (Flaviviridae) se ročně nakazí přes 400 milionů lidí. Při současné pandemii viru SARS-CoV-2 (Coronaviridae) se po celém světě nakazilo již více než 750 milionů lidí. Methyltransferázy se podílejí na vytvoření tzv. čepičky na 5' konci virové RNA. Čepička je struktura, která zvyšuje stabilitu a usnadňuje translaci RNA. Znalost struktury a funkce proteinů NS5 (methyltransferáza u Flaviviridae), nsp14 a nsp16 (methyltransferázy u Coronaviridae), je nezbytná pro navazující vývoj jejich inhibitorů. Ty by jako antivirotika mohly pomoci s léčbou virových onemocnění způsobených koronaviry a flaviviry.
The aim of this bachelor's thesis is a structural and functional description of viral methyltransferases of important human +ssRNA viruses from the families Coronaviridae and Flaviviridae. Over 400 million people are infected with diseases such as Dengue, Yellow fever, or Japanese encephalitis (Flaviviridae) every year. During the current pandemic of the SARS-CoV-2 virus (Coronaviridae), more than 750 million people have already been infected worldwide. Methyltransferases are involced in the synthesiz of the cap structure at the 5' end of the viral RNA, which increases its stability and facilitates translation. A detailed structural understanding of proteins NS5 (Flaviviridae methyltransferase), nsp14 and nsp16 (Coronaviridae methyltransferases) is necessary for the subsequent development of their inhibitors. As antivirals, these could help with the treatment of viral diseases caused by coronaviruses and flaviviruses.