Webový plugin pro vizualizaci sady sekundárních struktur RNA

Abstract

The study of RNA is important to better understand evolution or some diseases. In this thesis, we present a library written in Typescript that offers methods for visual analysis of multiple RNA secondary structures, but preferably work best with two or three structures. For the representation we use radial diagram, which is generated by template-based method. Methods used in the library for analysis use the template-based generation of the radial diagram by mapping diagrams generated from the same template to each other via the template, so that differences and similarities of structures can be observed. 1

Zkoumání RNA je důležité pro lepší pochopení evoluce nebo některých onemocnění. V této práci představujeme knihovnu napsanou v jazyce Typescript, která nabízí metody pro vizuální analýzu více sekundárních struktur RNA, nejlépe ale metody fungují pří práci s dvěmi nebo třemi strukturami. Pro reprezentaci používáme radial diagram, který je vygenerovaný na základě vzorové struktury. Metody použité v knihovně pro analýzu využívají způsobu generování radial diagramu a to tak, že diagramy vygenerované ze stejné vzorové struktury na sebe mapuje právě pomocí vzorové struktury, díky tomu lze sledovat rozdíly a podobnosti struktur. 1