Hypotetický protein Spr1962 jako nový substrát signalizační dráhy Ser/Thr proteinkinázy StkP a fosfatázy PhpP.
Hypothetical protein Spr1962 as a new substrate of the signalling pathway of the Ser/Thr protein kinase StkP and phosphatase PhpP.
diploma thesis (DEFENDED)
Item with restricted access
Whole item or its parts have restricted access until 01. 06. 2026
Reason for restricted acccess:
protection of information protected by a special law
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/181420Identifiers
Study Information System: 231199
Collections
- Kvalifikační práce [19600]
Author
Advisor
Referee
Fišer, Radovan
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Microbiology
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
1. 6. 2023
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
Streptococcus pneumoniae, proteinkináza StkP, fosforylace, protein Spr1962, fosfatáza PhpP, flotilin, funkční membránové mikrodoményKeywords (English)
Streptococcus pneumoniae, StkP protein kinase, phosphorylation, Spr1962 protein, PhpP phosphatase, flotillin, functional membrane microdomainsHypotetický protein Spr1962 jako nový substrát signalizační dráhy Ser/Thr proteinkinázy StkP a fosfatázy PhpP Extracelulární lidský patogen Streptococcus pneumoniae kóduje ve svém genomu pouze jednu serin/threoninovou proteinkinázu eukaryotního typu (StkP) a příslušnou PP2C fosfatázu (PhpP), proto je unikátním modelovým organismem pro studium signalizačních drah u bakterií. Dosud bylo identifikováno a charakterizováno několik substrátů těchto signalizačních proteinů, mezi které patří například proteiny DivIVA, KhpB, FtsA, FtsZ, MacP, GlmM, GpsB, ComE a další. Jedná se o proteiny, které se účasní různých buněčných procesů, včetně buněčného dělení a syntézy peptidoglykanu. Pomocí globální fosfoproteomové studie založené na LC-MS analýze bylo zjištěno, že jedním z identifikovaných proteinů je hypotetický protein Spr1962, jehož fosforylace byla detekována pouze v hyperfosforylovaném kmeni s odstraněnou fosfatázou PhpP. Cílem této práce byla charakterizace nového substrátu Spr1962 a objasnění jeho možné funkce. Vzhledem k významné strukturní podobnosti s flotilinovým proteinem bakterie Bacillus subtilis FloT bylo navrženo, že by se mohlo jednat o protein s analogickou funkcí u pneumokoka. Bylo zjištěno, že odstranění tohoto genu způsobuje fenotyp zvětšených buněk na různých genetických pozadích. Sledováním...
Hypothetical protein Spr1962 as a new substrate of the signalling pathway of the Ser/Thr protein kinase StkP and phosphatase PhpP The extracellular human pathogen Streptococcus pneumoniae encodes in its genome only a eukaryotic-type serine/threonine protein kinase (StkP) and the corresponding PP2C phosphatase (PhpP) in its genome. This makes it a unique model organism for the studying of signaling pathways in bacteria. To date, several substrates of this signaling protein have been identified and characterized, including DivIVA, KhpB, FtsA, FtsZ, MacP, GlmM, GpsB, ComE and others. These proteins are involved in various cellular processes, including cell division and peptidoglycan biosynthesis. In a global phosphoproteome study based on the LC- MS approach, one of the potential new substrates was the hypothetical protein Spr1962, whose phosphorylation was detected only in the hyperphosphorylated strain with deleted PhpP phosphatase. The aim of this work was to characterize this new substrate Spr1962 and to clarify its possible function. Based on the significant structural similarity to Spr1962 the FloT flotillin protein of Bacillus subtilis, it was suggested that it might be a protein with an analogous function in pneumococci. Deletion of this gene in different genetic backrounds was found to cause an...