Non-template activities of DNA/RNA polymerases and their significance

Abstract

Non-templated addition of adenosine on the 3' end of the product of several DNA polymerases commonly used in molecular biology has been a problematic yet unexplained phenomenon for a few decades now. The only other instance where adenosine is added to the 3' end of an information molecule in a cell is polyadenylation. At the same time, several RNA viruses appear to perform similar action to either edit or polyadenylate their mRNAs. This work focuses on the details of these three highlighted processes and relationship between them and has found out that all of them appear to stem from a common conserved property of the ancestral polymerase. Key words: DNA polymerase, RNA polymerase, non-templated addition, Taq polymerase, polyadenylation

Netemplátové přidávání adenosinu na 3' konec produktu u některých DNA polymeráz často využívaných v molekulární biologii je dosud neobjasněný fenomén, se kterým se potýkáme již několik desetiletí. Existuje jen málo jiných příležitostí, při kterých dochází k netemplátovému přidávání adenosinu na 3' konec informační molekuly v buňce, a jednou z nich je právě polyadenylace. Zároveň je známo, že určité RNA viry vykazují podobné aktivity v rámci polyadenylace či ko-transkripční modifikace svých mRNA. Tato práce se zaměřuje na detaily těchto tří procesů, na vztahy mezi nimi a dochází k závěru, že jsou všechny odvozeny ze stejné konzervované vlastnosti ancestrální polymerázy. Klíčová slova: DNA polymeráza, RNA polymeráza, netemplátová syntéza, Taq polymeráza, polyadenylace