Photoaffinitive conjugation of biomolecules
Fotoafinitní spojování biomolekul
bachelor thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/181145Identifiers
Study Information System: 255482
Collections
- Kvalifikační práce [20304]
Author
Advisor
Referee
Vrábel, Milan
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Biology
Department
Department of Cell Biology
Date of defense
29. 5. 2023
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
click chémia, fotochemický proces, bioorthogonálna chémia, fotoafinitné značenie, chemická biológiaKeywords (English)
click chemistry, photochemical process, bioorthogonal chemistry, photoaffinity labeling, chemical biologyFoto-click chémia zahŕňa skupinu foto-aktivovateľných click reakcií, ktoré sú význačné presnou priestorovou a časovou kontrolou, vysokou selektivitou a kvantitativnými výťažkami. Táto práca sa zameria na niekoľko hlavných tried svetlom kontrolovaných reakcií a pokúsi sa popísať ich chémiu v reverzibilných (nukleofilných) a ireverzibilných (cykloadičných a Diels- Alderových) reakciách iniciovaných po ožiarení fotoaktívneho prekurzoru. Derivatizáciou fotoaktívnych prekurzorov je možné posunúť absorpciu látky do viditelného spektra a teda uskutočniť nedeštruktívnu excitáciu in vivo, čo ponúka značný potenciál v biologicky zameranom výskume. Význam click fotochémie spočíva v neobyčajnej selektivite, ktorá umožňuje, aby reakcie prebiehali v komplexných, nekontrolovaných biologických prostrediach. Foto-aktivovateľné prekurzory je možné konjugovať s biologicky významnými skupinami, čo predstavuje metódu častokrát využívanú vo fotoafinitnom značení. Reaktivita fotoaktívnych substrátov voči biologickým nukleofilom bola skúmaná v rôznorodých oblastiach aplikovaného výskumu - popis a diskusia recentného úsilia bude taktiež témou tejto práce.
Photoclick chemistry represents a class of photo-activated click reactions generally characterised by precise spatial and temporal control, high selectivity, and quantitative yields. The following thesis will focus on several classes of light triggered click reactions and attempt to outline their chemistry in reversible nucleophilic addition, irreversible cycloaddition and Diels-Alder reactions initiated upon irradiation of photoactive precursors. The absorption of such precursors can be shifted towards visible light by derivatization of their chromophoric moieties, which allows for a non-harmful excitation in vivo and therefore offers promising prospects in biological applicability. The importance of click photochemistry resides in a remarkable selectivity that enables reactions to take place in highly complex, non-controlled biological environments. The photo-inducible precursors can be conjugated with various moieties of biological significance - a method most notably used in photoaffinity labelling. Considerable efforts have been made to explore the reactivity of photoactivatable compounds towards biological nucleophiles in various spheres of applied research which will all be discussed and summarised.