Vztah variability velikosti genomu a vybraných biologických charakteristik pavoukovců

Abstract

Genome size, also called C-value, describes the amount of DNA contained in haploid set of chromosomes in organism. Knowledge of this value can be useful for example as indicator of technical difficulty and financial cost of projects using genome seqencing, or it can be used for taxonomic purposes as well. Genome size encompasses immense variability across the animal kingdom. We also encounter variability among arachnids, even between species within the same genus. However, the relationship between genome size and biological characteristics of arachnids has not been examined so far. In this thesis, I assembled genome size data for all arachnid orders alongside with a variety of their biological characteristics. These traits were subsequently mapped onto the phylogenetics trees. In certain arachnid orders, the genome size could be related to the body size, life span and potentially also to ecology (e.g. web type, retreat). Unfortunatelly, genome size data are available only for a small portion of Arachnida diversity, which complicates the interpretation.

Velikost genomu, nazývána také C-hodnota, vyjadřuje množství DNA obsažené v haploidní sadě chromozomů organismu. Znalost této hodnoty může být užitečná například jako ukazatel technické a finanční náročnosti projektů zahrnujících genomové sekvenování, nebo může být využívána k taxonomickým účelům. Velikost genomu dosahuje velké variability napříč celou živočišnou říší. S variabilitou se setkáváme i mezi pavoukovci, a to i v rámci druhů stejného rodu. Doposud však nebyla zkoumána souvislost mezi velikostí genomu pavoukovců a jejich biologickými charakteristikami. V této práci byly shromážděny data o velikosti genomu jednotlivých řádů pavoukovců a jejich biologické charakteristiky, tyto údaje byly následně vymapovány na fylogenetické stromy. Velikosti genomu by u jednotlivých řádů pavoukovců mohly souviset s velikostí těla, délkou života a případně ekologií (typ sítě, úkrytu). Vzhledem k celkové diverzitě pavoukovců jsou však data o velikosti genomu k dispozici jen pro velmi málo druhů, což značně znesnadňuje jejich interpretaci.