Molekulárně genetická proměnlivost netopýrů rodu Hypsugo v západní Palearktidě
Molecular genetic variation of bats of the genus Hypsugo in the western Palaearctic
diploma thesis (DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/179548Identifiers
Study Information System: 197679
Collections
- Kvalifikační práce [20134]
Author
Advisor
Referee
Vallo, Peter
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Zoology
Department
Department of Zoology
Date of defense
2. 2. 2023
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Good
Keywords (Czech)
molekulárně genetická analysa, proměnlivost, Hypsugo, PalearktidaKeywords (English)
molecular genetic anaysis, variation, Hypsugo, PalaearcticV západní Palearktidě se vyskytují tři druhy rodu Hypsugo. Druh Hypsugo arabicus se podle dostupných zdrojů vyskytuje pouze ve dvou oblastech, na jihu Íránu (provincie Sístán a Balúčistán) a na severovýchodě Ománu. Areál Hypsugo ariel lemuje západ Arabského poloostrova a lze ho také nalézt v Egyptě a Súdánu. Poslední druh, Hypsugo savii můžeme nalézt v širokém spektru oblastí od Kanárských ostrovů přes západní, střední a jižní Evropu, Balkán až po Blízký východ a Střední Asii. Vnitrodruhové a mezidruhové vztahy těchto tří druhů nebyly dosud v dostatečné míře zkoumány. Na základě dat získaných sekvencí mitochondriálních a jaderných markerů byla provedena fylogenetická analýza, která doplňuje informace o vnitrodruhových a mezidruhových vztazích populací tohoto rodu v západní Palearktidě. Pro molekulární analýzu byly použity dva mitochondriální markery (Cyt-b a D-loop) a čtyři jaderné markery (Rag2 a introny ACOX, COPS, STAT). Následně byly ve fylogenetické analýze použity metody Bayesovské analýzy a metoda Maximum likelihood pro vytvoření fylogenetických stromů. Dále byly vytvořeny haplotypové sítě a byly spočítány p-distance mezi jednotlivými populacemi. U druhu H. arabicus byla na základě analýzy mitochondriálního genu pro cytochrom b zjištěna značná genetická divergence mezi populacemi Íránu a...
Three species of the genus Hypsugo occur in the Western Palearctic. According to available sources, the species Hypsugo arabicus occurs only in the south of Iran (provinces of Sistan and Baluchistan) and in the northeast of Oman. The range of Hypsugo ariel lines the west of the Arabian Peninsula and can be also found in Egypt and Sudan. Hypsugo savii can be found in a wide range of areas from the Canary Islands through Western, Central and Southern Europe, the Balkans to the Middle East and Central Asia. The intraspecific and interspecific relationships of these three species have not yet been sufficiently investigated. Based on the data obtained from the sequences of mitochondrial and nuclear markers, a phylogenetic analysis was performed, which supplements the information on the intraspecific and interspecific relationships of the populations of this genus in the Western Palearctic. Two mitochondrial markers (Cyt-b and D-loop) and four nuclear markers (Rag2 and ACOX, COPS, STAT introns) were used for molecular analysis. Subsequently, Bayesian analysis methods and the Maximum likelihood method were used in the phylogenetic analysis to create phylogenetic trees. Furthermore, haplotype networks were created and p-distances between individual populations were calculated. In the species H. arabicus,...