Faktory ovlivňující buněčnou adhesi a tvorbu kvasinkových biofilmů na pevném povrchu
Factors influencing cell adhesion and the formation of yeast biofilms on solid surfaces
diploma thesis (DEFENDED)
Item with restricted access
Whole item or its parts have restricted access until 25. 01. 2026
Reason for restricted acccess:
protection of information protected by a special law
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/179508Identifiers
Study Information System: 231830
Collections
- Kvalifikační práce [20332]
Author
Advisor
Consultant
Váchová, Libuše
Referee
Groušl, Tomáš
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Genetics, Molecular Biology and Virology with specialisation in Molecular biology and genetics of eukaryotes
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
25. 1. 2023
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
Czech
Grade
Excellent
Keywords (Czech)
biofilm, adheze, FLO11, Cyc8p, Tup1p, YJM320, klinické izoláty Saccharomyces cerevisiae a Candida glabrataKeywords (English)
biofilm, adhesion, FLO11, Cyc8p, Tup1p, YJM320, clinical isolates of Saccharomyces cerevisiae a Candida glabrataKvasinky jsou jednobuněčné mikroorganismy, které se přirozeně shlukují a tvoří mnohobuněčné strukturované útvary. Jedním z těchto útvarů je biofilm, jehož klíčové vlastnosti jsou u kvasinky Saccharomyces cerevisiae podmíněny expresí genu FLO11. Rozsáhlý promotor genu FLO11 je cílem několika drah a faktorů, výsledkem je složitá regulace tohoto genu. Mezi regulátory genu FLO11 patří i konzervované proteiny Cyc8p a Tup1p, které hrají roli v regulaci mnoha procesů, a to především jako korepresorový komplex. V předchozích letech byl v naší laboratoři prokázán antagonistický efekt regulátorů Cyc8p a Tup1p na adhezi kmene BRF (Nguyen et al., 2018). Ve své práci jsem mimo jiné zjišťovala, zda tato regulace platí i u vytipovaného klinického izolátu S. cerevisiae YJM320 a zda stejně jako u kmene BRF funguje pozitivní regulace FLO11 přes Tup1p a negativní regulace přes Cyc8p nebo je u tohoto kmene jejich vliv odlišný. Širším cílem mé práce byla identifikace role různých faktorů na adhezi, jakožto na první krok při tvorbě biofilmu. Má práce začínala testováním vlivu živin a teploty na adhezi kmenů BY, BRS a BRF a pokračovala testováním adheze vybraných klinických izolátů Saccharomyces cerevisiae a kmenů Candida glabrata za odlišných podmínek. Právě během těchto testů byl vytipován kmen Saccharomyces cerevisiae...
Yeasts are unicellular microorganisms that naturally aggregate to form multicellular structures. One of these formations is biofilm. The key properties of biofilm in S. cerevisiae are determined by the expression of the FLO11 gene. The large FLO11 gene promoter is the target of several pathways and factors, resulting in the complex regulation of this gene. Among the regulators of the FLO11 gene are the conserved Cyc8p and Tup1p proteins, which play a role in the regulation of many processes, especially as a corepressor complex. In previous years, our laboratory has demonstrated an antagonistic effect of the Cyc8p a Tup1p regulators on adhesion of BRF strain (Nguyen et al., 2018). In my work, I investigated whether this regulation is also valid in the selected clinical isolate S. cerevisiae YJM320 and whether, as in the BRF strain, positive regulation of FLO11 via Tup1 and negative regulation via Cyc8 exist here or whether their effect is different in this strain. The broader goal of my work was to identify the role of various factors on adhesion as the first step in biofilm formation. My work began by testing the effect of nutrients and temperature on the adhesion of strains BY, BRS and BRF and continued by testing the adhesion of selected clinical isolates of Saccharomyces cerevisiae and Candida...