Rapidly mutating Y-STRs analysis as a tool for forensic investigations, genetic genealogical applications and molecular anthropology
Využití analýzy rychle mutujících Y-STR lokusů v kriminalistice, genetické genealogii a molekulární antropologii
bachelor thesis (DEFENDED)

View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/179297Identifiers
Study Information System: 226649
Collections
- Kvalifikační práce [20356]
Author
Advisor
Referee
Doubková, Klára
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
Biology
Department
Department of Anthropology and Human Genetics
Date of defense
31. 1. 2023
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Very good
Keywords (Czech)
Y chromozom, Y-STR, RM Y-STR, Y-SNP, Haplotyp, Forensní, Genealogie, AntropologieKeywords (English)
Y chromosome, Y-STR, RM Y-STR, Y-SNP, Haplotype, Forensic, Genealogy, AnthropologyVe srovnání se standardními Y-STR markery běžně užívanými ve forenzních oborech a bioarcheologii mají rychle mutující Y-STR markery (RM Y-STR) ve světových populacích podstatně vyšší haplotypovou diverzitu a rozlišovací schopnost. Jedná se o novinku v těchto oborech. Tato práce se pokusí objasnit jejich původ, funkci a efektivnost ve forenzní genetice, genealogii a molekulární antropologii pohledem na Y chromozom a jeho charakteristiky, které umožnují jeho využití při mapování populací, jednotlivých mužských linií, a identifikaci mužských pachatelů sexuálního násilí. Pohledem na ostatní polymorfismy Y chromozomu, především Y-SNP markery, zjistíme, ve kterých studiích je každý typ nejvhodněji využit. Na konci se objasní, jestli je použití RM Y-STR markerů přínosné pro jednotlivé obory, jestli učiní standardní Y-STR markery redundantní, nebo jestli jsou sami v porovnání bez podstatného využití.
Compared to standard Y-STR markers commonly used in forensics and bioarchaeology, rapidly mutating Y-STR markers (RM Y-STR) have a significantly higher haplotype diversity and lineage resolution abilities in world populations. They form a novelty in these fields. This paper will attempt to clarify their origin, function, and efficacy in forensic genetics, genealogy, and molecular anthropology by looking at the Y chromosome and its characteristics that allow its use in the mapping of populations, individual male lineages, and identifying male perpetrators of sexual violence. By looking at other polymorphisms of the Y chromosome, especially Y-SNP markers, we can see in which studies each type is used most effectively. In the end, it will be clarified whether the use of RM Y-STR markers is beneficial to each field, whether they make standard Y-STR markers redundant, or whether they are themselves of no substantial use in comparison.