Optimalizace signálu tripletních stavů pigmentů ve fotosystému I

Abstract

The main objective of the thesis is to improve signal-to-noise ratio for pigments' triplet states in photosystem I. The sample was purified from cyanobacterium Thermosynecho- coccus elongatus. Based on the measurements we could deduce that the sample with optimal concentration has an absorbance about 0,7. It is beneficial to remove oxygen for example by nitrogen bubbling. Anaerobic conditions help to increase the lifetime of ca- rotenoid triplet states and to protect the sample from damage. Depending on the time of measurement we choose the maximal energy of the excitation pulse, which does not cause any significant damage to the photosystem. For the measurement, which takes about two hours, we find it is optimal to use the excitation energy from 1,5 mJ to 2 mJ. The re- laxation processes in the photosystem are fast during the first 100 ns. It is, therefore, necessary to use the shortest detection time, which is in our case a gate of 2 ns. At the later delays, it is possible to increase the gate to about 10 ns and at the same time to decrease the amplification of the measurement light (gain) so the final intensity of the signal would not change. This will contribute to a significant reduction of noise for the later delays. 1

Cílem práce je zlepšení signálu tripletních stavů pigmentů ve fotosystému I a mini- malizace šumu ve výsledných datech. Pro měření byl použit vzorek extrahovaný ze sinice Thermosynechococcus elongatus. Z měření vyplývá, že ideální je volit ne příliš koncent- rovaný vzorek (s absorbancí kolem 0,7), ze kterého například metodou bublání dusíkem odstraníme kyslík. Anaerobní podmínky zvýší dobu života tripletního stavu karotenoidů a také vzorek částečně chrání před poškozením. V závislosti na délce experimentu zvolíme maximální energii excitačního pulzu, která ještě nepůsobí významné poškození fotosys- tému. Pro dvouhodinové měření se nám osvědčila intenzita 1,5 až 2 mJ. Pro zachování dobrého časového rozlišení je vhodné přibližně prvních 100 ns, kdy probíhají děje ve fo- tosystému velmi rychle, sbírat signál pouze po krátkou dobu 2 ns. Následně je tuto dobu (gate) možné zvýšit na 10 ns a naopak snížit zesílení měřicího světla (gain) tak, aby se nezměnila velikost výsledného signálu. Tím také výrazně přispějeme ke snížení celkového šumu. 1