Vegetation of post-mining sites determines soil microbial community structure and soil processes
Vegetace na těžebních lokalitách určuje strukturu půdního mikrobiálního společenstva a průběh půdních procesů
dissertation thesis (NOT DEFENDED)
View/ Open
Permanent link
http://hdl.handle.net/20.500.11956/152819Identifiers
Study Information System: 83163
Collections
- Kvalifikační práce [20084]
Author
Advisor
Referee
Chroňáková, Alica
Bárta, Jiří
Faculty / Institute
Faculty of Science
Discipline
-
Department
Department of Genetics and Microbiology
Date of defense
17. 12. 2014
Publisher
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakultaLanguage
English
Grade
Fail
Keywords (Czech)
ekologie mikroorganismů, dekompozice, sukceseKeywords (English)
microbial ecology, decomposition, successionDisertační práce, jejímž základem jsou tři publikované články a jeden článek předložený k publikování, je zaměřena na ohodnocení vlivu vegetace na půdní mikrobiální společenstva a procesy na místech vzniklých během těžby hnědého uhlí. Studované lokality sloužily jako úložiště neúrodného odpadního materiálu, kterým byla postupně pohřbívána původní vegetace a tím byl celý ekosystém zničen. Obnova struktury ekosystému a jeho funkcí na těchto územích je založena na zlepšení biotických a abiotických vlastností vytěženého půdního substrátu, buď zalesňováním nebo ponecháním ploch přirozené rostlinné sukcesi. V této práci byly použity biochemické a molekulárně-biologické metody pro testování vlivu vegetace na mikrobiální procesy, strukturu mikrobiálních společenstev a pro sledování změn v chemickém složení opadu během jeho rozkladu. Chemické složení opadu, enzymové aktivity a mikrobiální biomasa byly stanovovány pomocí obvyklých biochemických metod zahrnujících spektrometrii a HPLC. Bakteriální microarray byl použit pro určení složení bakteriálního společenstva na sukcesních plochách. 454-pyrosekvenování bylo použito pro podrobnější identifikaci houbových a bakteriálních společenstev v opadu a půdě pod různými druhy stromů. Bylo prokázáno, že vegetace podstatně ovlivňuje vývoj půdního ekosystému, jeho...
This thesis consists of three published articles and one submitted article, and is focused on the evaluation of the effects of vegetation on soil microbial communities and processes on brown coal post-mining sites. The research sites served as deposits of infertile waste material, by which the indigenous vegetation has been buried and thus the whole ecosystem was destroyed. The restoration of the ecosystem structure and functions at these areas was based on the improvement of biotic and abiotic properties of excavated soil substrate either using assisted afforestation or using spontaneous plant succession. In this work, biochemical and molecular techniques were employed in order to testify the effect of the vegetation on soil microbial processes, structure of soil microbial communities and to follow the chemical changes in the litter composition during its decomposition. Litter chemistry, enzymatic activities and microbial biomass were followed by standard biochemical procedures including spectrometry and HPLC. Bacterial microarray was used for assessing the composition of bacterial communities in the soil of successional plots. 454-pyrosequencing was employed for detailed identification of fungal and bacterial community composition in the litter layer and the bulk soil under different tree...