Příprava DNA vazebné domény transkripčního faktoru FOXK2

Abstract

Transkripční faktory jsou specifické proteiny, které jsou schopny regulovat trankripci a které se na základě strukturních motivů dělí do jednotlivých rodin. Jednou z těchto rodin je i rodina FOX, do které se řadí i transkripční faktor FOXK2, jež byl předmětem studia této práce. Protein FOXK2 reguluje mnoho buněčných dějů včetně buněčné proliferace a metabolismu a má neméně důležitou roli při karcinogenezi, neboť jeho zvýšená exprese byla zaznamenána v případech rakoviny plic, jater a ledvin. V rámci této práce byla připravena DNA vazebná doména trakripčního faktoru FOXK2 rekombinantní expresí v buňkách Escherichia coli. Získaný protein byl poté purifikován a byla studována jeho interakce s DNA pomocí nativní hmotnostní spektrometrie.

Transcription factors are specific proteins, which are able to regulate transcription and which are divided into individual families based on structural motifs. One of these families is the FOX family, which also includes the transcription factor FOXK2, which was the studying subject of this work. The FOXK2 protein regulates many cellular processes, including cell proliferation and metabolism and plays an important role in carcinogenesis, as its high expression has been reported in cases of lung, liver and kidney cancer. In this work, the DNA binding domain of the transcription factor FOXK2 was prepared by recombinant expression of Escherichia coli cells. The obtained protein was afterwards purified and its interaction with DNA was studied by native mass spectrometry.