Mechanizmy regulácie mikrobiomu počas ovulačného cyklu myši domácej.

Abstract

Existuje len málo prác, ktoré by poskytovali prehľad charakteristík estrálneho cyklu, súvislosť estrálneho cyklu s fyziologickým prejavmi, akým je pH vaginálneho prostredia, ako aj dynamika vaginálnej mikrobioty u divokých myší. Cieľom tejto práce je prispieť k pochopeniu dynamického vzťahu medzi vonkajšími vplyvmi na fyziológiu samičieho reprodukčného systému, vyvinutie spoľahlivej metodiky na meranie pH vaginálneho mikroprostredia u myší a kvantifikovať celkovú abundanciu niektorých bakteriálnych rodov porovnaním metód sekvenovania a qPCR. Výsledky naznačujú, že najvýraznejší vplyv na predĺženie fázy estru má fyzická prítomnosť samca v klietke, na rozdiel od nesignifikantnej čuchovej stimulácie močom. Taktiež sa ukázalo, že kolísanie pH vaginálneho prostredia má cyklický charakter a metóda qPCR ukazuje, že zloženie vaginálnej mikrobioty sa počas fázy estru výrazne odlišuje od ostatných fáz estrálneho cyklu, čo potvrdilo aj 16S rRNA sekvenovanie. Tieto výsledky teda prinášajú komplexný pohľad na premenlivosť estrálneho cyklu s dôrazom na premenlivosť vaginálnej mikrobioty a zmenu pH prostredia. Kľúčové slová: myš, estrálny cyklus, estrus, pH, mikrobiota, qPCR

There is a very few papers to provide an overview of the characteristics of the estrous cycle, the relationship of the estrous cycle to physiological manifestations such as the pH of the vaginal environment, as well as the dynamics of the vaginal microbiota in wild mice. The aim of this thesis is to contribute to the understanding of the dynamic relationship between external influences and the physiology of the female reproductive system, to develop a reliable methodology for measuring the pH of the vaginal microenvironment in mice as well as to quantify the overall abundance of some bacterial taxons by comparing sequencing and qPCR methods. The results suggest that the physical presence of the male in the cage has the most significant effect on the prolongation of the estrus phase, in contrast to non-significant olfactory stimulation of the urine. Fluctuation in the pH of the vaginal environment have also been shown to be cyclic, and the qPCR method shows that the composition of the vaginal microbiota, during the estrus phase, differs significantly from other phases of the estrous cycle, as we confirmed by 16S rRNA sequencing. Thus, these results provide a comprehensive view of the variability of the estrous cycle with an emphasis on the variability of the vaginal microbiota and the change in the...