Analýza kmenů Staphylococcus aureus rezistentních k meticilinu vyskytujících se v České republice a na Slovensku

Abstract

Meticilin rezistentní Staphylococcus aureus (MRSA) je významným nozokomiálním patogenem, který se však od 90. let 20. století čím dál více vyskytuje i v komunitě (CA-MRSA). Obecně jsou komunitní kmeny virulentnější, avšak méně rezistentní než nemocniční (HA- MRSA). Některé linie MRSA, jako např. sekvenční typ 8 byly v šíření úspěšnější než jiné a rozšířily se na více místech ve světě. Je známo hned několik příkladů, kdy byly dominující linie nahrazeny jinými. Klíčové faktory rozhodující o výběru dominantní linie nejsou vždy zcela zřejmé. V rámci této diplomové práce byla provedena longitudinální studie epidemiologie MRSA ve Fakultní nemocnici v Motole v období 2018-2020, s charakterizací výskytu klonálních komplexů. Zároveň byla provedena multicentrická studie epidemiologie MRSA na Slovensku v období leden - duben 2020. Dále bylo několik izolátů z dominantních linií fenotypově charakterizováno. Ve FN Motol byl zjištěn vysoký výskyt klonálního komplexu 5 se zastoupením spa-typu t586, což je ve shodě s recentními studiemi v ČR. Převážné zastoupení klonálního komplexu 5 bylo zjištěno i na Slovensku. Rozdílem však byly signifikantní záchyty i jiných sekvenčních typů a klonálních komplexů, jako např. EMRSA-15 (20 % izolátů). Dalším významným objevem byl záchyt klonu USA300, který je epidemickým klonem v...

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is a major nosocomial pathogen that has spread into the community since the 90s. In general, the community-associated (CA- MRSA) strains are more virulent, but less resistant to antimicrobials than the hospital- acquired strains (HA-MRSA). Some lineages of MRSA such as sequence type 8 have been transmitted more successfully around the world than others and there are situations where a dominant lineage has been replaced by a new one. The factors that are crucial for the selection of dominant lineage are often not clear. As part of this thesis, a longitudinal study of MRSA epidemiology in the Motol University Hospital during the period of 2018-2020 was performed and the occurrence of MRSA clonal complexes was characterized. A multicenter study of the epidemiological situation of MRSA in Slovakia during the period of January - April 2020 was also performed concomitantly. Moreover, several isolates from dominant lineages were further characterized by their phenotype. In the Motol University Hospital study, it was found that the HA-MRSA of the clonal complex 5 dominates and is represented mainly by spa-type t586; a finding that concurs with recent studies from the Czech Republic. In Slovakia, similar to the Czech Republic, MRSA lineages from clonal...